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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » ADF/Dalton » 【求助】关于ADF的输入例子文件（30金币相送）
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

[交流] 【求助】关于ADF的输入例子文件（30金币相送）

我是ADF新手，向版内高手求一个关于ADF计算的例子输入文件，或者将文件内容直接贴出来也行
文件输入中应该设置了几何构型优化，频率计算，如何设置方法、基组，我想使用常用的B3LYP泛函，doulbe zeta外加polarize基组。另外如何设置成多CPU并行（节点内），如何设置内存大小，如何对对称性或者点群的检查标准进行控制，如何提交计算还请告知，最好将内容贴出来，然后逐行解释一下，对热心提供帮助者，将以30金币相送
可用如下的CO坐标作例子：

O      .000000     .000000     .000000
C      .000000     .000000    1.128100

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 19:59 ]
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
1楼 2008-11-25 15:57:17
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tangsw911

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★ ★
hairan(金币+1,VIP+0):谢谢提供，不过那里面主要讲的是GUI的使用技巧，我们这里没有GUI，只好手动编写，因此需要详细介绍
spur(金币+2,VIP+0): 3Q！！谢谢参与！
这个网站有，可以看一下

http://59.77.33.35/cgi-bin/topic ... ic=1326&show=50
赞一下(16人) 回复此楼
2楼2008-11-25 17:58:04
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
hairan(金币+8,VIP+0):很感谢你贴出来的内容，能否逐条解释一下，另外，charge那个地方的两个0是电荷和多重度吗？还是电荷和单电子数？
hairan(金币+5,VIP+0):谢谢指点
spur(金币+3,VIP+0): 3Q！！谢谢参与！欢迎常来！
杂化泛函极慢，只能算小分子，而且不能做解析梯度和解析频率计算。这是个CO2 rpbe/tz2p opt + freq + 4cpu并行的输入例子

#! /bin/sh
export NSCM=4

$ADFBIN/adf  << eor > test.out
Title test

define
r1=1.25
a1=180.0
end

atoms Z-matrix
C 0 0 0
O 1 0 0  r1
O 1 2 0  r1 a1
end

restricted
CHARGE 0 0

relativistic scalar zora

Basis
Type TZ2P
Core NONE
End

integration 6.0

XC
GGA RPBE
End

Geometry
  convergence grad=1e-4
End

AnalyticalFreq
End

End input
eor
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2008-11-26 00:51:51
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lihb734

铁杆木虫 (职业作家)

站在计算化学入门的门槛上
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
spur(金币+4,VIP+0): 3Q！！谢谢参与！欢迎常来！
hairan(金币+5,VIP+0):好几天没来了，刚看到，你解释的很详细，多谢. 我试试你的例子，有问题还要随时请教你
#! /bin/sh  ! 指定LINUX下的shell


$ADFBIN/adf -n 1 << eor  !调用ADF程序，-n 1 表示用一个CPU，1可以改变。ADF动态分配内存，故不需要指定，只要机器的内存足够就可以了。
Title simple NBO example for water  ! 标题行，作用和高斯中的标题行一样

Atoms    Z-Matrix   !分子说明区间
O   0 0 0
H   1 0 0   0.9
H   1 2 0   0.9  100
End
  
Basis   !基组说明
CORE NONE
TYPE DZP
End

GEOMETRY !任务类型，几何优化
END

ANALITICALFREQ !解析频率，可以与几何优化连用；不能用解析时，可以用数值的，
END            方法：拷贝出构型，然后在GEOMETRY中的新行中添加FREQUENCIES即可，不能用几何优化连用

XC  !泛函的选取，几何优化不能用B3LYP
  LDA VWN
  GGA PW91
END

ENDINPUT !表示结束
END
EOR

对称行默认为你的模型的对称性，通常不需要指定。

下行为同任务
./test.inp > test.out & linux环境的指令


就值楼主五个金币。

[ Last edited by lihb734 on 2008-12-16 at 10:58 ]
赞一下(14人) 回复此楼
前途光明，出路难觅！
4楼2008-12-10 12:19:27
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