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SNP筛选标准参数
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大家好， 我在文献中看到这样一段话： 总共有53个体和7175 SNP位点符合stringent quality control measures， （minor allele frequency maf>0.05; maximum per-SNPs missing geno>0.05; linkage disequilibrium pruning indep=50,5,0.5） 疑问是：不明白后两个参数的意思（maximum per-SNPs missing与linkage disequilibrium pruning），请问是否有人了解？谢谢。 |
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