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csutzk

木虫 (小有名气)


[求助] 跑了几次纳米团簇结合,出现了一些问题

如下图双团簇,首先建立一个晶体盒子,然后把建好的两个团簇靠近,然后在NPT下进行跑40000次左右,但是出现的问题是没有改变,之前靠近的时候两个团簇之间有成键了。在NPT下跑 盒子变得越来越小。请问大神,NPT系综下,压力是加在了晶体盒子上么?如果是,怎么样改到加到团簇的各个方向。

之后想利用NPT,多原子,跑了80000步,想看这个盒子缩小后会不会继续让纳米团簇移动结合,但是纳米团簇会抛出盒子,跟两个的不一样。这里是不是需要优化一下?

跑了几次纳米团簇结合,出现了一些问题
双原子.PNG


跑了几次纳米团簇结合,出现了一些问题-1
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跑了几次纳米团簇结合,出现了一些问题-2
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csutzk

木虫 (小有名气)


或者说如何让两个纳米团簇  相隔一定的距离,然后通过系综下的动力学模拟,生成键连接
2楼2016-10-09 16:10:20
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er8210228

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by csutzk at 2016-10-09 16:10:20
或者说如何让两个纳米团簇  相隔一定的距离,然后通过系综下的动力学模拟,生成键连接

楼主是用的MS中的nanocluster画的吗?如果是的,那么空位浓度应该怎么设置呢?还有下面的选项是否应该选呢?我是初次接触金属纳米团簇,还不知道该怎么画图
跑了几次纳米团簇结合,出现了一些问题-3
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3楼2017-03-28 21:06:46
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