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csutzk

木虫 (小有名气)

[求助] 跑了几次纳米团簇结合，出现了一些问题

如下图双团簇，首先建立一个晶体盒子，然后把建好的两个团簇靠近，然后在NPT下进行跑40000次左右，但是出现的问题是没有改变，之前靠近的时候两个团簇之间有成键了。在NPT下跑 盒子变得越来越小。请问大神，NPT系综下，压力是加在了晶体盒子上么？如果是，怎么样改到加到团簇的各个方向。

之后想利用NPT，多原子，跑了80000步，想看这个盒子缩小后会不会继续让纳米团簇移动结合，但是纳米团簇会抛出盒子，跟两个的不一样。这里是不是需要优化一下？

跑了几次纳米团簇结合，出现了一些问题
双原子.PNG


跑了几次纳米团簇结合，出现了一些问题-1
1.PNG


跑了几次纳米团簇结合，出现了一些问题-2
2.PNG
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1楼 2016-10-09 15:04:00
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csutzk

木虫 (小有名气)
或者说如何让两个纳米团簇  相隔一定的距离，然后通过系综下的动力学模拟，生成键连接
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2楼2016-10-09 16:10:20
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er8210228

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by csutzk at 2016-10-09 16:10:20
或者说如何让两个纳米团簇  相隔一定的距离，然后通过系综下的动力学模拟，生成键连接

楼主是用的MS中的nanocluster画的吗？如果是的，那么空位浓度应该怎么设置呢？还有下面的选项是否应该选呢？我是初次接触金属纳米团簇，还不知道该怎么画图
跑了几次纳米团簇结合，出现了一些问题-3
123.png
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3楼2017-03-28 21:06:46
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