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firo1994

新虫 (初入文坛)

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[交流] 分子微生物生态学及环境基因组技术培训班通知【感兴趣的可以看看】已有1人参与

分子微生物生态学及环境基因组技术培训班通知
尊敬的各位专家、教授，您好：
四川博贝特生物科技有限公司联合中国科学院成都生物研究所将于2016年11月4日-6日举办第二届《分子微生物生态学及环境基因组》技术培训班，培训以微生物分子生态学及环境基因组技术的实际上机操作为主，围绕高通量测序数据处理、环境基因组数据分析、生态统计学方法进行培训。热忱邀请您的参加，期待您的技术与学术分享。
一、培训日程：
         日期会议主题                                        会议内容
11月5日（1）分子微生物生态学基础
a、物种进化的“三域学说”  b、群落结构与多样性研究
         （2）  环境基因组技术基础
a.测序技术，生物信息学
      （3）测序技术平台介绍
a、二代测序Illumina平台 b、三代Pac Bio测序技术
   （4）Bioedit软件应用和 NCBI Blast简介
a、Bioedit软件应用  b、NCBI Blast简介
   （5）高通量测序样品准备操作流程
a、生物样本采集 b、样本基因组DNA/RNA提取 c、高通量引物的选取 d、PCR扩增、产物回收及混样e、建库及上机测序
(6)利用Qiime平台处理测序数据
a、Qiime及相关软件介绍;  b、去杂，提取barcoded序列，去除chimera，重取样; c、OTU及代表性序列的生成，物种分类; d、进化树构建; e、群落组成及结构差异分析; f、alpha多样性，beta多样性分析
(7)、UniFrac PcoA分析及提交序列到数据库
a、数据库介绍
  b、提交序列到European Nucleotide Archive
11月6日（1）宏基因组数据分析
a、宏基因组数据分析原理及平台介绍；
（2）MG-RAST平台分析宏基因组数据
a、物种组成及丰度分析; b、功能基因组成及分类分析;  c、代谢通路分析;
(3)生态统计学方法培训
a、生态统计学方法
(4)  微生物菌群之间，以及微生物菌群与环境因子之间的相互关系分析
a、相关性分析：Pearson correlation, (Partial) Mantel test
b、排序分析：CCA、RDA
c、方差分析：ANOVA、PERMANOVA、Variance partitioning analysis（VPA）
d、因果关系：Pathway analysis （PLS-PM）
(5)参观环境基因组技术实验室、高通量测序仪
二、培训安排
报到时间：2016年11月4日全天报到
报到地点：锦江之星成都磨子桥店（四川省成都市武侯区科华北路36号）
培训时间：2016年11月5日-6日，早上9:00开始，下午 2：00开始。
培训地点：中国科学院成都生物研究所行政楼2楼会议室

三、住宿安排
1、差旅费及食宿费用自理。提供会议期间的盒饭午餐。
2、酒店预订：会务组协助提供协议酒店，培训人员需自行电话预定，预定时请说明“博贝特生物科技”即可享受协议价。
3、协议酒店：锦江之星成都磨子桥店。地址:四川省成都市武侯区科华北路36号。房间优惠价：标间230元含早餐，单间230元含早餐。最好提前一周预定,联系电话（4008209999/028-85216536）。

四、注册方式
1、报名时间
报名从即日起至2016年11月3日止。
2、培训费
共计2500元/人（含教材费等）。
3、缴费方式（电子汇款）
户名：四川博贝特生物科技有限公司
开户行：中国农业银行股份有限公司成都川大花园支行
账号： 22836101040009280
汇款用途处务必请标明：学员姓名+环境基因组培训班
缴费后请发送“汇款凭证照片+发票抬头+学员姓名”至1021543760@qq.com
4、联系人:王群  邮箱: 1021543760@qq.com
报名者请填写以下回执，并于2016年11月4日前E-mail至联系人邮箱1021543760@qq.com。如有其它需要，请在备注中说明。

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