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weijie2013

金虫 (著名写手)

[求助] 论文要求上传数据,是自己做实验的原始数据吗?全部传他们能保密吗? 已有1人参与

3. We have noticed that the following questions on the Minimum Standards of Reporting Checklist have not been answered:

* Availability of data and materials
- Links to deposited datasets, or datasets in additional files, should be explicitly referenced in a section entitled “Availability of Data and Materials”. Guidance on where to deposit your data can be found on the Availability of Data and Materials policy page.
- If computer code was used to generate results that are central to the paper’s conclusions, include a statement in the “Availability of data and materials” section to indicate how the code can be accessed. Include version
information and any restrictions on availability. For deposited data and published
code, a full reference with an accession number, doi or other unique identifier should be included in the reference list.
- If reproducible materials are generated as a result of the research (for example new animal mutants), a statement on their availability should be included.   这个怎么处理啊?怎么传,同类的文章,他们是传到NCBI里面,怎么传过去?论文要求上传数据,是自己做实验的原始数据吗?全部传他们能保密吗?还有用的是中文的记录方法,可以吗?

论文要求上传数据,是自己做实验的原始数据吗?全部传他们能保密吗?


论文要求上传数据,是自己做实验的原始数据吗?全部传他们能保密吗?-1


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草叶青

新虫 (初入文坛)

您好,同遇到此问题,请问您后来是怎么解决的呢,请教您一下
2楼2017-03-22 22:19:17
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草叶青

新虫 (初入文坛)

您好,同有此疑惑,现在也遇到这个问题,请问您后来是怎么处理的呢,还望您交流一下。
3楼2017-03-22 22:20:38
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weijie2013

金虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 草叶青 at 2017-03-22 22:20:38
您好,同有此疑惑,现在也遇到这个问题,请问您后来是怎么处理的呢,还望您交流一下。

把数据传到figur share 一个英文的数据共享中心,就像百度云盘共享一样,也可用百度云分享就怕国外他们连接不到!就是这样!英文有很多数据共享平台!随便一个都可以!加油!我的已经在线出版了!

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4楼2017-03-31 08:05:27
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blackmira

木虫 (小有名气)

变形虫

【答案】应助回帖

1.必须上传,且是“deposited datasets, or datasets in additional files”,即数据相关信息最终会被公开在相应数据库中,但楼主若担心数据泄露,可以选择若干年后公开,我印象里最多可以到5-6年后。

2.这里要传的数据,根据你的材料有所不同。

宏基因组学研究:
需要上传两个数据:1)原始序列(未经质控)到SRA,以及经过你质控-组装-拼接所得的完整基因组(如果做了拼接工作的话)

单基因组研究:
对特定物种的全基因组测序后的结果,需标明该物种的详细信息(就是你列的 Minimum Standards of Reporting Checklist,是个excel表,可以从NCBI GenBank上下载)

3.具体上传方法:
我最近在向NCBI传一包拼接后的病毒基因组,结果各种出问题,用了sequin,中间诸多波折...现在转向EMBL数据库尝试上传,才看到楼主是去年这时候的帖子...不知道上传成功了么?如果情况类似,还得请教楼主了 :)
5楼2017-10-23 16:33:34
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