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0502114073

木虫 (正式写手)

[求助] 高斯优化中,能否固定一部分,而只优化另外一部分呢?

比如石墨烯吸附CO,我怎么固定石墨烯,只优化CO分子,请教各位高手,谢谢!!
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小范范1989

木虫 (著名写手)

★ ★
zhou2009: 金币+2 2016-09-26 08:41:47
固定的部分可以写-1(在坐标和元素符号之间)
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
2楼2016-09-26 08:32:05
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0502114073

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小范范1989 at 2016-09-26 08:32:05
固定的部分可以写-1(在坐标和元素符号之间)

您的意思 直接在坐标和元素符号之间写-1,比如下面例子Fe(NH2)4  我要固定一个NH2就写成如下格式:

%chk=0007_H8N4Fe_neutral.chk
%mem=16GB
%nprocshared=16
# opt=gdiis freq b3lyp/6-311+g* geom=connectivity scf=(maxcycle=200,xqc)

Title Card Required

0 5
Fe                -0.91754600   -0.46831100    0.27157400
H                 -1.45244500   -0.76586600    1.83722800
N                  0.16000600    1.48253700    0.21099400
H                  1.14777100    1.24446300    0.16141600
H                 -3.16465200    1.08078500   -0.70341000
N                  4.18178500   -0.54864800   -0.29920800
H                  0.02178700    2.02434800    1.05949300
H                 -0.06401700   -1.31732100   -0.90479000
N                  3.37090400    0.17099000   -0.13735000
H                 -0.03924300    2.08668100   -0.58176900
H       -1        -3.54974800   -0.38967500   -0.09381000
N       -1       -2.87137700    0.10755200   -0.66468000
H       -1        -2.93247200   -0.27433300   -1.60356000

1
2
3 4 1.0 7 1.0 10 1.0
4
5 12 1.0
6 9 3.0
7
8
9
10
11 12 1.0
12 13 1.0
13
3楼2016-09-26 08:56:59
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小范范1989

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 0502114073 at 2016-09-26 08:56:59
您的意思 直接在坐标和元素符号之间写-1,比如下面例子Fe(NH2)4  我要固定一个NH2就写成如下格式:

%chk=0007_H8N4Fe_neutral.chk
%mem=16GB
%nprocshared=16
# opt=gdiis freq b3lyp/6-311+g* geom=connect ...

对,不过你的任务是不是想优化+freq?我感觉,计算的时候,表头写的越简单越好,而且你这个maxcycle=200压根就没有用。
我感觉就写opt freq就行。乱七八糟的命令不要写。除非出现的问题,调节收敛等等。个人见解

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It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
4楼2016-09-26 09:25:35
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0502114073

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 小范范1989 at 2016-09-26 09:25:35
对,不过你的任务是不是想优化+freq?我感觉,计算的时候,表头写的越简单越好,而且你这个maxcycle=200压根就没有用。
我感觉就写opt freq就行。乱七八糟的命令不要写。除非出现的问题,调节收敛等等。个人见解...

好的,谢谢,我优化过程中总是出现不收敛,这个是出现了震荡 所以写成这样形式,我随便拿了一个当例子的,受教了。非常感谢!!!怎么给你金币?
5楼2016-09-26 09:38:27
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