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jianjunjiang铁杆木虫 (正式写手)
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gromacs 计算氢键自相关函数输出结果的意思是什么
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各位专家: 我在用gromacs计算氢键,为了输出氢键的自相关函数,在g_hbond指令后加了-ac指令,输出结果中有一个hbac.xvg文件,格式如下: ac # # g_hbond is part of G R O M A C S: # # Great Red Owns Many ACres of Sand # @ title "Hydrogen Bond Autocorrelation" @ xaxis label "Time (ps)" @ yaxis label "C(t)" @TYPE xy @ view 0.15, 0.15, 0.75, 0.85 @ legend on @ legend box on @ legend loctype view @ legend 0.78, 0.8 @ legend length 2 @ s0 legend "Ac\sfin sys\v{}\z{}(t)" @ s1 legend "Ac(t)" @ s2 legend "Cc\scontact,hb\v{}\z{}(t)" @ s3 legend "-dAc\sfs\v{}\z{}/dt" 0 1 1 -2.83987e-005 0.195192 1 0.811893 0.822584 7935 0.124644 2 0.750712 0.764881 8078 0.0540954 。。。。 其中第三列是自相关函数,第五列是自相关函数对时间的导数,第四列指的是什么呢? 谢谢大家! |
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