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碧海游龙

新虫 (正式写手)

[交流] 微生物相对多样性数据分析 已有5人参与

小白请教两个问题,为什么多样性的分类是在门的层级不是种或者属啊;另外那个相对多样性的数据怎么看,怎么一个柱状条里面有多条数据

微生物相对多样性数据分析
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秋天fall1

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个数据应该是基因组的高通量测序结果,一个柱状图里面不同的颜色代表不同的门或属。不同的命令出来的图就是不同门、科、属等等。

发自小木虫Android客户端
8楼2016-11-01 11:32:56
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查看全部 8 个回答

yanlijuan

新虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这是细菌群落的组成,属这个分类太细了,柱状图没那么多颜色显示,而且看起来起来会更复杂。一个柱状条显示的不同的phyla(门)的相对丰度,合起来就是100%所有细菌啦。

发自小木虫IOS客户端
2楼2016-09-13 01:43:04
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微基生物

捐助贵宾 (小有名气)

技术专员


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
在分析时,应该会在门、纲、目、科、属、种这6个分类水平上,每个水平给一张图。你想分析哪个水平,就用哪个水平的图。
现在用靶基因测序时,70-80%可以检测到属了。
写文章时,可以根据自己的目的,选择不同水平上的群落组成图。
专注微生物多样性分析QQ2758452825
3楼2016-09-13 14:55:13
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碧海游龙

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yanlijuan at 2016-09-13 01:43:04
这是细菌群落的组成,属这个分类太细了,柱状图没那么多颜色显示,而且看起来起来会更复杂。一个柱状条显示的不同的phyla(门)的相对丰度,合起来就是100%所有细菌啦。
...

谢谢
4楼2016-09-14 01:22:49
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