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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 如何利用LAMMPS产生层错
汕头大学海洋科学接受调剂
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wangwen552

铜虫 (小有名气)

[求助] 如何利用LAMMPS产生层错 已有2人参与

请各位大侠帮忙看一下下面的内容如何用LAMMPS实现：
我想用LAMMPS计算层错能，看了几篇文献都是说把一个晶体分成两部分（比如上下两部分），一部分固定，另一部分相对做一个柏氏矢量的刚性移动，通过LAMMPS计算势能以此计算层错能，试了几次都不成功，哪位大侠知道到底怎样在LAMMPS中实现一部分固定，另一部分刚性移动啊？跪求帮忙！
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1楼 2016-09-09 16:10:04
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badercao

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wangwen552: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-09-13 16:27:21
本帖内容被屏蔽

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

wangwen552
2楼2016-09-09 19:29:37
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wangwen552

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by badercao at 2016-09-09 19:29:37
fix rigid
fix setforce
fix addforce

大神你好，能否详细说明一下，这几个命令我都试过，但是总是不对。我是建了一个单晶，沿着Y方向分为上下两个region(block)，也是两个group，我是想固定下半部分，将上半部分沿着X方向有一个柏氏矢量的刚性位移，那个fix rigid命令是只针对上半部分吗？还有后面两条命令分别是针对哪一部分呢？还有如果用了fix rigid命令，那系综是不是默认就是nve了，可我需要LAMMPS计算的是势能，如果用了nve那最后系统的能量都相等了这不就矛盾了吗？纠结死了。。。
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3楼2016-09-11 10:20:47
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lx_PICO

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wangwen552: 金币+10, ★有帮助 2016-09-13 16:27:05
http://wenku.baidu.com/view/9053 ... a4.html?from=search
这个上海交大引入柏氏矢量的写的还可以，但是稍微有的繁杂，你参考参考吧
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4楼2016-09-11 13:12:42
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wangwen552

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lx_PICO at 2016-09-11 13:12:42
http://wenku.baidu.com/view/90536b3bee06eff9aef807a4.html?from=search
这个上海交大引入柏氏矢量的写的还可以，但是稍微有的繁杂，你参考参考吧

多谢！我去看一下
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5楼2016-09-11 13:17:14
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badercao

禁虫 (正式写手)
本帖内容被屏蔽
6楼2016-09-11 16:29:12
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wangwen552

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by badercao at 2016-09-11 16:29:12
大神谈不上，只是针对你讲的，我觉得用上面的命令可能会实现。（1）fix rigid 命令针对group。（2）后面两条命令是加力的另外一种方法。（3）使用fix rigid也是可以计算势能的，具体check一下manual。 如果还有疑问 ...

恩，谢谢！
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7楼2016-09-12 09:39:05
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leoluode

银虫 (小有名气)
同学，请问你现在是采用什么命令做刚性位移的啊？我现在采用fix setforce 刚性固定原子，并且加diaplace_atoms实现位移，但是感觉计算的不正确啊，不知道你现在哟想到什么好的方法没有呢？
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8楼2016-11-25 16:19:43
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leeve

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by leoluode at 2016-11-25 16:19:43
同学，请问你现在是采用什么命令做刚性位移的啊？我现在采用fix setforce 刚性固定原子，并且加diaplace_atoms实现位移，但是感觉计算的不正确啊，不知道你现在哟想到什么好的方法没有呢？

displace_atoms 是在计算（simulations）前对原子进行位移（参手册），与计算层错时的刚性位移应该不是一个概念
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9楼2018-03-24 16:43:59
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Stoudemire29

金虫 (小有名气)
8楼同学在吗？fix setforce 和displace_atoms的用法能介绍一下吗？新手一枚
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共同进步
10楼2018-10-29 14:58:14
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