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空境弥音

新虫 (初入文坛)

[交流] 关于病毒基因图谱和数据库比对

请问各位研究使用的病毒基因组数据库有哪些呢?例如H5,H9亚型禽流感病毒,新城疫,传染性支气管炎,减蛋综合征等……


因为工作岗位,现在做的课题跨了专业,问了周围的人但是没有人知道,自己在网上搜索又找不到资源,所以弱弱地请各位做过的盆友来传授一下经验……

楼主以前主要做模式植物和微生物,用到的一些资源可能大部朋友都知道,不过还是拿出来分享下~拟南芥数据库用的主要是TAIR,AMP。文献主要用NCBI,CELL,还有一些特别出名的就不赘述啦。基因比对用BLAST,除了拟南芥外还可以比对人类,水稻,大鼠等等。

楼主这里还有一些载体图谱例如OE(S1300),永久GFP(S1300-GFP),瞬时GFP,28a,1381,1391,AD,BD(pGBKT7),N-N1,C-C1。如果有需要图谱可以的话可以留邮箱~质粒的话现在没有了,都在学校里……

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