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蛋白质组学实验的多肽酶解物要过10K滤膜吗?
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jiafeijiafei
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蛋白质组学实验的多肽酶解物要过10K滤膜吗?
我最近在做蛋白质质谱,提取的蛋白跑SDS-PAGE,银染脱色,还原烷化,酶解,提取酶解物,冻干,复溶进质谱。我看有的文献说在提取酶解物之后冻干之前要进10K滤膜。不知道过10K滤膜的作用和意义是什么,过滤膜之后多肽不会有损失吗?哪个牌子的好用一些呢?
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xiaofuss111
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5楼
2016-08-31 08:14:55
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DECHIBIO
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jiafeijiafei(金币+1): 谢谢参与
10K滤膜表示分子量大小小的;你是希望把多大分子量多肽过滤掉的
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6楼
2016-08-31 10:16:44
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jiafeijiafei
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DECHIBIO
at 2016-08-31 10:16:44
10K滤膜表示分子量大小小的;你是希望把多大分子量多肽过滤掉的
我不滤掉的,我的操作是酶解提取酶解液,我的想法是可以滤掉凝胶残渣,这样滤过液直接冻干成干粉再复溶就进液相做质谱了。我这个思路对吗?
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7楼
2016-08-31 11:10:25
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王老吉2016
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这需要根据你的方案来制定的,你需要搜集的肽片段在多少的,你就选择多大的微孔滤膜,跑2-DE应该不会选择10K滤膜了。
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2016-09-05 13:21:52
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protemics
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超滤主要是脱盐,去除尿素以及其他可能干扰酶活性的小分子
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9楼
2016-09-05 15:42:07
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Originally posted by
王老吉2016
at 2016-09-05 13:21:52
这需要根据你的方案来制定的,你需要搜集的肽片段在多少的,你就选择多大的微孔滤膜,跑2-DE应该不会选择10K滤膜了。
我是跑1D的PAGE胶,切胶 脱色 还原烷化 酶解,酶解后直接吸取酶解液冻干的,然后干粉复溶就进质谱的,可是我的难题就是怎么去除SDS,还有吸取酶解液之后需不需要其他处理再冻干啊
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10楼
2016-09-05 20:48:22
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jiafeijiafei
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9楼
:
Originally posted by
protemics
at 2016-09-05 15:42:07
超滤主要是脱盐,去除尿素以及其他可能干扰酶活性的小分子
我是跑SDS PAGE胶,银染 切胶 脱色 还原烷化 酶解,酶解后直接吸取酶解液冻干的,然后干粉复溶就进质谱的,可是我的难题就是怎么去除SDS,还有吸取酶解液之后需不需要其他处理再冻干啊
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11楼
2016-09-05 20:49:14
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bwang377
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
多肽分子量较小,一般在10kDa以下~
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12楼
2016-09-06 15:37:36
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dsctg
2楼
2016-08-30 12:50
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syhorchid
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2016-08-30 13:26
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slytjiaofei
4楼
2016-08-31 07:21
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