应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » siesta中计算怎么得不到PDOS文件
31/1返回列表
查看: 806  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

785524519

金虫 (正式写手)

[求助] siesta中计算怎么得不到PDOS文件 已有1人参与

请问我的输入文件错在哪里为什么运行后报错。下面是输入的fdf（PS例子在电脑运行成功了，确定是参数设置的问题）

# graphene nanoribbons

SystemName          2N-GNR
SystemLabel         2N-GNR

LongOutput T
WriteMullikenPop 1
WriteCoorXmol T
NumberOfAtoms          66
NumberOfSpecies        3

xc.functional          GGA
xc.authors             PBE

OccupationFunction      MP

SpinPolarized           F

%block ChemicalSpeciesLabel
  1   6  C
  2   1  H
  3   7  N
%endblock ChemicalSpeciesLabel


%block PAO.BasisSizes
    C       SZP
    H       DZP
    N       SZP
%endblock PAO.BasisSizes



#SaveHS T   

MeshCutoff           300.0 Ry       # Mesh cutoff. real space mesh

# SCF options
MaxSCFIterations      75            # Maximum number of SCF iter
DM.MixingWeight       0.1           # New DM amount for next SCF cycle
DM.Tolerance          1.d-4         # Tolerance in maximum difference
DM.NumberPulay         5
DM.UseSaveDM

SolutionMethod        diagon        # OrderN or Diagon

ElectronicTemperature  2000 K        # Temp. for Fermi smearing

AtomicCoordinatesFormat   Fractional         #NotScaledCartesianAng
AtomicCoorFormatOut        Ang
%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
0.206786108        0.499999996        0.9058832       2
0.206893432        0.500000006        0.096095974        2
0.206934732        0.5                0.239300927        2
0.207034616        0.499999999        0.429515568        2
0.207174604        0.500000002        0.572224101        2
0.206828751        0.500000008        0.762475974        2
0.796711172        0.500000001        0.906506278        2
0.796498259        0.499999997        0.096019891        2
0.796879867        0.499999997        0.239035675        2
0.794266025        0.499999998        0.431422053        2
0.795572176        0.5                0.571560397        2
0.796434418        0.5                0.761514294        2
0.255314193        0.499999966        0.947436934        1
0.255405355        0.50000004        0.05445741        1
0.255432659        0.500000001        0.280916773        1
0.255552436        0.499999997        0.387867583        1
0.255589283        0.5                0.614048523        1
0.255391109        0.500000046        0.720992259        1
0.31606203        0.500000001        0.890055334        1
0.377981194        0.499999989        0.944980013        1
0.378044032        0.499999947        0.056309125        1
0.316196832        0.499999995        0.111609696        1
0.316268723        0.500000003        0.223533467        1
0.378033175        0.500000009        0.278648411        1
0.378294899        0.499999998        0.389938553        1
0.316300823        0.499999993        0.445137476        1
0.316446995        0.499999999        0.556818377        1
0.378284457        0.500000002        0.61210275        1
0.377987304        0.499999994        0.72304208        1
0.316044807        0.500000019        0.778348346        1
0.440122956        0.499999998        0.88899193        1
0.501750762        0.499999985        0.945284496        1
0.501872504        0.500000055        0.056271502        1
0.440097309        0.500000003        0.112033971        1
0.44020366        0.500000013        0.223014774        1
0.501902618        0.500000042        0.278726581        1
0.50241978        0.499999968        0.389907568        1
0.440155267        0.500000006        0.445461035        1
0.44058112        0.500000006        0.555987776        1
0.502061062        0.499999939        0.611296292        1
0.502247687        0.499999949        0.72175377        1
0.44011181        0.499999987        0.77802138        1
0.563542985        0.499999993        0.889151475        1
0.625685724        0.499999964        0.945228378        1
0.625488219        0.500000051        0.056377657        1
0.563693132        0.499999974        0.11208507        1
0.563686064        0.499999986        0.223425777        1
0.625291965        0.500000017        0.27896078        1
0.563853011        0.499999979        0.444963221        1
0.625474889        0.499999997        0.612072739        1
0.625205769        0.50000001        0.722302761        1
0.563491319        0.500000058        0.779001128        1
0.687387529        0.499999977        0.889892196        1
0.74804438        0.500000004        0.947692464        1
0.747844089        0.499999979        0.054838358        1
0.687036172        0.499999985        0.112219506        1
0.687337033        0.50000001        0.224303935        1
0.748371046        0.499999975        0.280310382        1
0.746646624        0.499999972        0.387559565        1
0.687052922        0.499999954        0.444580524        1
0.686149193        0.500000011        0.556079659        1
0.747132747        0.500000002        0.613310192        1
0.747725913        0.500000002        0.720359499        1
0.68739654        0.499999998        0.777942701        1
0.624637481        0.500000105        0.390662139        3
0.563862082        0.500000153        0.555177413        3

%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies

%block LatticeVectors   
      20.000000000000014       0.000000000000001      -0.000000000000012
      -0.000000000000000      10.000000000000007       0.000000000000001
       0.000000000000000      -0.000000000000000      12.782529000000011
%endblock LatticeVectors

%block kgrid_Monkhorst_Pack
   10  0  0  0.5
   0  20  0  0.5
   0  0  20  0.5
%endblock kgrid_Monkhorst_Pack
SaveHS T
LatticeConstant       1 Ang   
# %block LatticeParameters  #
#  3.56680  3.56680  3.56680  90.0000  90.0000  90.0000
# %endblock LatticeParameters

# MD and Relaxations
#MD.TypeOfRun CG
#MD.VariableCell                true
#MD.MaxForceTol                0.04 eV/Ang
#MD.MaxStressTol                1.0 GPa
#MD.NumCGsteps                200
#MD.MaxCGDispl                0.2 Bohr

#BandLines
BandLinesScale                ReciprocalLatticeVectors

%block BandLines   
1   0.0  0.0   0.0  \G # Begin at Gamma
50  0.0  0.5   0.0   \F   # 50 points from gamma to Z
50  0.0  0.5   0.5   \Q
50  0.0  0.0   0.5   \Z
50  0.0  0.0   0.0   \G
%endblock BandLines

# Diag.ParallelOverK      T


#WriteEigenvalues          F

#ProjectedDensityOfStates
%block ProjectedDensityOfStates
   -15  10  0.3446  700 eV
%endblock ProjectedDensityOfStates

MD.UseSaveXV T
DM.UseSaveDM T
UseSaveData  T
回复此楼

» 猜你喜欢
Everything is going on,but don't give up trying.
1楼 2016-08-29 18:43:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

785524519

金虫 (正式写手)
弄了几天了  还是出问题 大家谁会的帮帮忙。。。
赞一下 回复此楼
Everything is going on,but don't give up trying.
2楼2016-08-29 18:45:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangguangping

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
785524519(蛋蛋小童鞋代发): 金币+4, 谢谢交流 2016-12-14 22:30:40
785524519: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 谢谢应助 2017-04-12 22:00:45
%block ProjectedDensityOfStates
   -15  10  0.3446  700 eV
%endblock ProjectedDensityOfStates

修改为：

%block ProjectedDensityOfStates
   -15.0  10.0  0.3446  700 eV
%endblock ProjectedDensityOfStates

siesta源代码有的时候读入的数据还是要求比较高的。
赞一下 回复此楼
弘德明志博学笃行
3楼2016-12-14 21:57:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 785524519 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭