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基因家族筛选
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我最近想筛选一下一种病原真菌的基因家族,看到有文献是用该家族的基因序列初步筛选的,但是也有用一致性序列(consensus sequence)初步筛选的。 那么,问题来了, 1、一致性序列(consensus sequence)=保守结构域( Conserved Domains)么? 2、如果用基因序列筛选,选哪种真菌的该基因的序列较为标准呢? 3、pfam建立蛋白结构域模型,这个必要么,而且pfam怎么用呢? 4、不会用perl的话,可以手动筛选么,毕竟真菌的基因组比较小,写文章的时候会不会比较low? 先想到这些,如果大家应助的话,记得选应助呀,我好发金币。谢谢~~~ |
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2楼2016-08-24 06:19:44

3楼2016-08-28 09:50:29
masterboyama
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