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wolfebst至尊木虫 (职业作家)
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[交流]
求助:质粒绘制软件WinPlas 2.7的一些问题
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最近我用WinPlas 2.7软件绘制线性的质粒图 但是画完以后发现无法导出 除了拷屏以外,请问各位高手是否还有其他办法? 很是着急这个事情 必有重谢 |
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synhily
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质粒绘图的专业软件——Winplas 2.7使用说明 Winplas作为一个质粒绘图的专业软件，功能强大，而且极易上手，它可以绘制出具有发表质量的质粒图谱。可广范应用于论文、教程的质粒插图，它的特性包括： 1， 无论是否知道质粒的原始序列都能绘制质粒图，像Vector NTI等综合软件也能绘制质粒图，但有一个前提就是首先得知道质粒得原始序列； 2， 可读入各种流行得序列格式文件，能方便地导入各种序列信息； 3， 可自动在识别序列中的限制性酶切位点； 4， 可对序列进行各种编辑，如：从文件插入序列、置换序列、序列编辑、部分序列删除等 5， 绘图功能强大，如：位点标签、任意位置文字插入、生成彩图、线性或环形质粒图谱，可输出到剪贴板或图像文件。 软件下载地址：http://www.bbioo.com/Soft/2008/2571.htm 一， 在不知道序列结构时绘制质粒图： 1， 点击File菜单中地New命令，出现一个MapView窗口，同时工具栏中地绘图命令显亮。 2， 点击“Insert”菜单中的“Blank Seqment”命令，出现一个“Create New Plasmid”对话框。 －在Title栏中填入质粒名称，如pUC18。 －在Base Pairs栏中填入质粒大小，如3000。 －在Type单选框中设制质粒图谱为线型还是环形。 3， 点击OK后，在Map View窗口就会出现一个圆环，其中有质粒名称及质粒大小。 4， 下面的工作就是向圆环上添加文字描述、标记及弧。 ①点击“Insert”菜单中的“Text”命令，或直接点击工具栏中的“Text”按纽，出现“Edit Text object”对话框。 －在“Text”书签中填入“Text”的内容，如：This is PUB 18’s map，选择左右对齐及居中。 －选定相应字符可以加黒、斜体等。 －在Font书签中改变字体格式、大小及颜色。 －文字就出现在Map View窗口中，使用鼠标左健，就可以随意拖动其位置。 ②点击“Insert”菜单中“Maker”命令或直接点击工具栏中的“Maker”按钮，出现”Edit Maker Object”对话框。 －此时，在Maker书签中的Base Pair填入添加Maker的位置，如800。 －在Label栏中，填入Maker的名称，如HindⅢ。同样可以改变HindⅢ的字体样式：加黑，斜体等。 －同样在Font书签中可以改变字体的样式、大小及颜色。 －点击OK，则在圆环800bp的相应位置出现HindⅢ的标记。 ③点击“Insert”菜单中“Arc”命令，弹出”Edit Arc Object”对话框。 －在Arc书签中的Base Pair栏中，填入Arc的起始位置，如1000。 －在Length栏中填入Arc的长度，如400。在Label栏中填入Arc的名称，如Amp。 －在Arc Style书签中，首先确定该Arc是否有箭头以及箭头的方向。分别对应none, 5’→3’,3’→5’,及双向。 －通过Width来确定Arc的宽度 －也可以调节箭头与Arc径宽度的比值 －改变填充样式以区分不同的Arc;改变Arc的颜色;同样也可以改变字体的样式、颜色等 －点击OK，则在图谱中1000－1400bp位置出现一个Arc，名称叫Amp。 5.相同的道理，我们可以随意加入其它的文字，标记及弧。下面，我们对初步得到的图谱进行编辑： —对于任何一个项目，如需要修改，我们只需用鼠标左键选中它，并双击，即可出现相应的编辑窗口，如： —对于文字及质粒名称、大小，我们可以用鼠标在任意位置拖放。 其它的修饰，点击Edit菜单中“Plasmid Options”命令，出现“Plasmid Options”对话框，在此，我们可以改变： ①、质粒环的粗细、大小（半径）环的颜色以及背景颜色。 ②、标记连线的粗细、颜色以及标出Marker的位置。 ③、Arc名称连线的粗细、颜色、Arc边缘的颜色。是否标记Arc的位置，并且可以把Arc的名称放在圆环的外面。 ④、当我们绘出自己满意的图形后： －可以直接通过打印机打印出来。“File”菜单“Print”命令。 －保存为Winplas文件，以后可以直接用Winplas打开，“File”菜单中“Save as”命令，选则保存位置及文件名即可。 －直接复制并到Word文档中粘贴。 －导出为通用图形文件：“File”菜单“Expont Graphic file”我们可以保存为PCX GIF TIF等文件。 二， 对于从GeneBank下载的已知序列及功能区的序列，Winplas可以根据要求生成质粒图谱。 1， 点击“File”菜单中“New”命令。 2， 点击“Insert”菜单，“GenBank file” 3， 选择要打开的文件：如PDR 322 GB_。 4， 点击打开后出现环、质粒名称及大小。 5， 此时我们可以像画空白质粒一样填加文字、标记、Arc，但更重要的是Winplas可以直接生成酶切位点和特征区，方法是：点击“Sequence”菜单中的“Restriction Enzgme”命令，出现“Select Restriction Enzgme”对话框，利用键盘上的Ctrl键及鼠标左键选中需要标记的酶，如果觉得所列的酶太多，也可以通过酶切位点数目来分类。 6， 点击OK，则在环上的相应位置出现酶的标记。 7， 点击“Sequence”菜单中的“Features”命令，在“Select Features”对话框中列出 所有特征功能区名称、位置、描述等。 8， 点击“OK”后，完成Features的标记。 9， 这时与绘制空白质粒一样，我们可以对它进行修饰、编辑并将结果保存或导出。 三， 对于普通的Sequence文件或保存成TXT格式的序列，Winplas同样可以生成质粒图，只是由于普通序列文件不包含功能区的信息，因此不能自动生成质粒图。 1， 点击“File”——new命令， 2， Insert菜单，“Sequence file“命令，打开一个普通的序列文件， 3， 其后的工作与前面所讲相似，不再多述。 也不是什么大忙，呵呵，不过你应该好好谢我！ [ Last edited by synhily on 2008-11-18 at 12:24 ] |
2楼2008-11-18 12:22:36
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