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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Turbomole/ORCA » 请教一个orca无法做并行计算的问题
汕头大学海洋科学接受调剂
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fooo

金虫 (正式写手)

[求助] 请教一个orca无法做并行计算的问题 已有1人参与

我的系统为fedora，解压orca后能够单核运算。为了做并行计算，我安装了openmpi2.0（安装命令./configure CC=gcc CXX=g++ FC=ifort），测试openmpi所带的examples也能通过。但是orca无法并行计算，错误信息如下：
orca_gtoint_mpi: Symbol `ompi_mpi_comm_world' has different size in shared object, consider re-linking
orca_gtoint_mpi: Symbol `ompi_mpi_comm_null' has different size in shared object, consider re-linking
ORCA finished by error termination in ORCA_GTOInt
输出文件末尾的出错信息如下：
mpirun noticed that process rank 1 with PID 0 on node huang3 exited on signal 11 (Segmentation fault).
--------------------------------------------------------------------------
ORCA finished by error termination in ORCA_GTOInt
这一问题实在无法解决，所以向大家求助，希望高人能够指点迷津。多谢！
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1楼 2016-08-20 21:11:29
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fooo: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-08-21 09:06:00
有可能是，openmpi的版本不对

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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

fooo
2楼2016-08-21 08:48:19
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)
可以考虑使用编译好的openmpi试试

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3楼2016-08-21 08:55:26
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fooo

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by qchem at 2016-08-21 08:48:19
有可能是，openmpi的版本不对

谢谢了！我试试其他版本的openmpi再说吧。
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4楼2016-08-21 09:03:03
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fooo

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by qchem at 2016-08-21 08:55:26
可以考虑使用编译好的openmpi试试

请问到哪里去找啊？我下载的是源程序，要自己编译。
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5楼2016-08-21 09:04:44
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)
不清楚，我是Ubuntu，apt get install装的

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6楼2016-08-22 06:45:19
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shalene

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
fooo: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-08-24 21:21:39
openmpi 1.65、1.75，orca3.03运行没问题；2.00，并行出错
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7楼2016-08-24 12:14:34
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fooo

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by shalene at 2016-08-24 12:14:34
openmpi 1.65、1.75，orca3.03运行没问题；2.00，并行出错

我先安装的是openmpi 2.0版本，后来又安装了1.4和1.6版本，可一直有问题。我后来发现可能这几个版本不能同时安装，于是删除干净后重新安装。现在orca终于能并行了。谢谢各位的帮助。

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8楼2016-08-24 21:20:55
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