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Jldbaobei木虫 (著名写手)
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【求助】计算过渡态得出的虚频一直很小
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计算过渡态时出现两个虚频 调整计算后剩下一个虚频 但是接下来不管怎么样对键长、键角、二面角做小的调整 产生的虚频总是在20左右—50之间 命令行中也加入了nosymm scf=tight 关键字 请问虚频的调整有什么技巧吗？ 怎么我弄来弄去它还是在这个区间里转啊 [ Last edited by lei0736 on 2008-11-29 at 11:18 ] |
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2楼2008-11-16 22:34:51
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
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我也是看的别人说的方法，你试试有没有用吧！ 在进行Gaussian计算时，经常会出现多个虚频个，每个都只有－30~－20左右，但是如果结构改动过大，则一不小心，虚频就会更大。消除虚频的主要方法是改变构型。其次在计算上还可以尝试：nosymm；加大循环次数；提高收敛度；iop(1/8=1)等。通常对于势能面很平，较小的虚频很难消除。 为了解决以上的这种现象,按如下的步骤一步步调整： 1）. 在优化时采用Scf(tight)的选项，增加收敛的标准。再去计算频率。如果还有虚频，参见下一步。 2）. 对称性的影响，很多情况下的虚频是由于分子本身的对称性造成的。这样，在优化时，如果必要，要将对称性降低，还有，输入文件有时是用内坐标。建议如果有虚频的话，将内坐标改成直角坐标优化。但是有时这一方法也并没有多大作用。 3）. 如果上述方法还有虚频，看一下虚频，找到强度较大的，将在频率中产生的原子的振动坐标加到相应的输入文件中。这样，重新计算。直到虚频没有。比较好的做法是分子结构输入用直角坐标，将这些产生虚频的振动坐标直接与原始坐标相加。加的时候不一定要将坐标直接相加，可以选择权重如1/3相加等。 4）. 实际上，如果分子柔性较大，很难找到最低点，这是电子结构计算的问题，这种情况下，需要动力学的 东西，用构象搜寻的办法解决。如：模拟退火，最陡下降法，淬火法等。将得到的能量最低的构象做一般的电子结构计算，这样，应当没有问题。 当出现两个以上虚频时，可以先看一下振动模式。如果多余的虚频，和想要的振动模式发生在不同原子上，可以先固定过渡态模式所对应的原子，然后做opt到minimal,一般可以把多余的虚频去掉，再放开做全优化。 |
3楼2008-11-17 09:09:14