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Arlequin中的AMOVA test 求助 已有1人参与
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这个是我的运算结果。 但是结果我有些不明白的地方，查询了使用手册也没找到答案。 Va and FST : P(rand. value > obs. value) = 0.15836 P(rand. value = obs. value) = 0.14272 P-value = 0.30108+-0.01355 1. P(rand. value > obs. value)这个是什么意思 2.为什么没有Vb and FST的结果 3.P 值并没有小于0.05，是因为数据不够多吗? 下面是完整的结果。 AMOVA ANALYSIS ================================================================= --------------------------- Genetic structure to test : --------------------------- No. of Groups = 1 [[Structure]] StructureName = "New Edited Structure" NbGroups = 1 #Group1 Group={ "BRUNNSVIKEN" "ASKÖ" } --------------------------- Distance method: Pairwise difference -------------------------- AMOVA design and results : -------------------------- Weir, B.S. and Cockerham, C.C. 1984. Excoffier, L., Smouse, P., and Quattro, J. 1992. Weir, B. S., 1996. ---------------------------------------------------------------------- Source of Sum of Variance Percentage variation d.f. squares components of variation ---------------------------------------------------------------------- Among populations 1 0.171 0.00259 Va 1.89 Within populations 27 3.623 0.13417 Vb 98.11 ---------------------------------------------------------------------- Total 28 3.793 0.13675 ---------------------------------------------------------------------- Fixation Index FST : 0.01891 ---------------------------------------------------------------------- Significance tests (1023 permutations) ------------------ Va and FST : P(rand. value > obs. value) = 0.15836 P(rand. value = obs. value) = 0.14272 P-value = 0.30108+-0.01355 //////////////////////////////////////////////////////////////////// END OF RUN NUMBER 1 (16/08/16 at 17:56:23)) Total computing time for this run : 0h 0m 0s 84 ms //////////////////////////////////////////////////////////////////// |
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