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鲨鱼宝宝

新虫 (小有名气)

[求助] Arlequin中的AMOVA test 求助 已有1人参与

这个是我的运算结果。
但是结果我有些不明白的地方,查询了使用手册也没找到答案。
Va and FST : P(rand. value > obs. value)  =  0.15836
             P(rand. value = obs. value)  =  0.14272
                                  P-value =  0.30108+-0.01355
1. P(rand. value > obs. value)这个是什么意思
2.为什么没有Vb and FST的结果
3.P 值并没有小于0.05,是因为数据不够多吗?
下面是完整的结果。








AMOVA ANALYSIS
=================================================================


---------------------------
Genetic structure to test :
---------------------------

No. of Groups = 1


    [[Structure]]

        StructureName = "New Edited Structure"
        NbGroups = 1
    #Group1
        Group={
        "BRUNNSVIKEN"
        "ASKÖ"
        }

---------------------------


Distance method: Pairwise difference

--------------------------
AMOVA design and results :
--------------------------


Weir, B.S. and Cockerham, C.C. 1984.
Excoffier, L., Smouse, P., and Quattro, J. 1992.
Weir, B. S., 1996.

----------------------------------------------------------------------
Source of                  Sum of      Variance         Percentage
variation      d.f.        squares     components       of variation
----------------------------------------------------------------------
Among
populations      1          0.171        0.00259 Va             1.89

Within
populations     27          3.623        0.13417 Vb            98.11
----------------------------------------------------------------------
Total           28          3.793        0.13675
----------------------------------------------------------------------
Fixation Index      FST :      0.01891
----------------------------------------------------------------------

Significance tests (1023 permutations)
------------------

Va and FST : P(rand. value > obs. value)  =  0.15836
             P(rand. value = obs. value)  =  0.14272
                                  P-value =  0.30108+-0.01355


////////////////////////////////////////////////////////////////////
END OF RUN NUMBER 1 (16/08/16 at 17:56:23))
Total computing time for this run : 0h 0m 0s 84 ms
////////////////////////////////////////////////////////////////////
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Assistover

铜虫 (小有名气)

你好,请问你有AMOVA和DCFA软件吗?能不能发我一下,非常感谢,我的网上下载的不能用。
2楼2016-11-20 10:44:55
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初来者

新虫 (初入文坛)

你好!我最近也在用这个软件计算Fst值,一直不会用,求赐教!

发自小木虫Android客户端
3楼2017-06-28 16:23:05
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武夜魅族

新虫 (正式写手)

4楼2017-12-17 00:16:45
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霁果霁果

新虫 (初入文坛)

楼主,你好!求赐教你是怎么计算的,不胜感激!
5楼2018-02-27 14:51:03
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lu_205012

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

请问楼主你这个数据是怎么得到的,是设置的原因吗,我的出来一大堆,看不懂,基本都是种群两两比对的结果,没有你这个,请不吝赐教
6楼2018-10-13 21:44:27
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