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liyaohui1990木虫 (小有名气)
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[求助]
Rosetta online server
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各位尊敬的虫友，近期我利用Hex 6.3 软件将两个蛋白进行对接后获得一个二聚体蛋白pdb文件，我想利用Rosetta online server进一步进行对接优化（http://rosie.rosettacommons.org/docking2/submit），但是我发现我将该pd.文件提交后，总是提示错误，如下：Validation failed as: proteins.pdb: Not enough chains in submitted protein! [At least 2 chains should be present, found chains: [u'A']...] the docking_partners must be specified。 现在不知道该怎么进一步操作，查找了相关文献，文献中提到 “Structures of the docking partners are uploaded in the standard Protein Data Bank (PDB) (14) coordinate file format as two separate files or as a single file with the docking partners separated by a TER record. ” 但是我发现Rosetta online server在蛋白－蛋白对接页面没有同时上传两个pdb文件的选项，但是如果只上传一个pdb文件，该怎么操作呢？求各位虫友赐教。感激不尽！！！可以直接留言，也可以给我发送QQ信息414348830，感激不尽！ |
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