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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS是否可以分别求水和氧气二元体系的均方位移
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2368126698

新虫 (小有名气)

[求助] MS是否可以分别求水和氧气二元体系的均方位移 已有1人参与

在用MS求氧气和水的二元体系的无限稀释扩散系数或者互扩散系数时，在dynamic后，分析MSD，貌似只有一条总的均方位移曲线，请问各位，是否可以分别得到水和氧气的均方位移曲线？可以的话，又该如何操作？谢谢了
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1楼 2016-08-15 10:37:03
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leebrave

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
2368126698: 金币+5, ★★★很有帮助 2016-08-16 10:07:36
当然可以，在轨迹文档中定义你的set 水和氧气，在分别MSD就出来了。
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不慌，平常心，一步一步走过来。
2楼2016-08-16 08:59:56
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leebrave

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
2368126698: 金币+3, ★★★很有帮助 2016-08-18 20:40:16
引用回帖:
4楼: Originally posted by 2368126698 at 2016-08-18 10:48:50
请问，在轨迹文档中定义set需要选中需要水分子和氧气分子吗？如果需要的话，那么在一个盒子里面又有水，又有氧气，该如何定义呢？谢谢了...

当然要在轨迹文档中操作，把你想分析的水分子和氧气分别选中，分别定义set。
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不慌，平常心，一步一步走过来。
5楼2016-08-18 17:53:18
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普通回帖

2368126698

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by leebrave at 2016-08-16 08:59:56
当然可以，在轨迹文档中定义你的set 水和氧气，在分别MSD就出来了。

谢谢
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3楼2016-08-16 10:07:51
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2368126698

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by leebrave at 2016-08-16 08:59:56
当然可以，在轨迹文档中定义你的set 水和氧气，在分别MSD就出来了。

请问，在轨迹文档中定义set需要选中需要水分子和氧气分子吗？如果需要的话，那么在一个盒子里面又有水，又有氧气，该如何定义呢？谢谢了
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4楼2016-08-18 10:48:50
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2368126698

新虫 (小有名气)
就是一个盒子里面，既有水，又有氧气，混乱的，我不知道如何分别选中它们，不知道该如何操作？::

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6楼2016-08-18 20:39:40
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tony第123

木虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 2368126698 at 2016-08-18 20:39:40
就是一个盒子里面，既有水，又有氧气，混乱的，我不知道如何分别选中它们，不知道该如何操作？::

楼主，您好！你在定义水、O2为set时，是选中所有的H2O分子还是只选中一个H2O分子就够了啊？谢谢
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7楼2016-12-13 15:59:54
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2368126698

新虫 (小有名气)
所有的

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8楼2016-12-13 21:07:53
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2368126698

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by tony第123 at 2016-12-13 15:59:54
楼主，您好！你在定义水、O2为set时，是选中所有的H2O分子还是只选中一个H2O分子就够了啊？谢谢...

所有的

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9楼2016-12-13 21:08:14
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tony第123

木虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 2368126698 at 2016-12-13 21:08:14
所有的
...

谢谢！

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10楼2016-12-13 22:11:59
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