应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 用MPICH3.2, BLACS,LAPACK.SCALAPACK安装siesta
152/2返回列表上一页12
查看: 2741  |  回复: 14
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

Alpha s

新虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by guohuazhong at 2016-08-12 18:31:41
贴出你的arch.make文件吧...

你帮我看看，是不是arch.make文件有问题呢，
赞一下 回复此楼
11楼2016-08-13 20:37:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
Alpha s: 金币+50, ★★★很有帮助 2016-08-15 10:06:50
蛋蛋小童鞋: 金币+2, 谢谢参与，鼓励积极回答问题者 2016-08-15 10:15:56
不太清楚你的计算机上的编译环境，比如用的是什么版本的fortran编译器，并行环境等等，arch.make看不出什么问题来，另外，你可以在终端中使用 gedit  ~/.bashrc打开.bashrc文件，在文件中加入 ulimit -c unlimited以及ulimit -s umlimited 试试

下面是我的arch.make,你可以参考一下，重点是你要修改库文件以适合你自己电脑上的所安装的库
#
# This file is part of the SIESTA package.
#
# Copyright (c) Fundacion General Universidad Autonoma de Madrid:
# E.Artacho, J.Gale, A.Garcia, J.Junquera, P.Ordejon, D.Sanchez-Portal
# and J.M.Soler, 1996- .
#
# Use of this software constitutes agreement with the full conditions
# given in the SIESTA license, as signed by all legitimate users.
#
.SUFFIXES:
.SUFFIXES: .f .F .o .a .f90 .F90

SIESTA_ARCH=x86_64-unknown-linux-gnu--unknown

FPP=
FPP_OUTPUT=
FC=mpif90
RANLIB=ranlib

SYS=nag

SP_KIND=4
DP_KIND=8
KINDS=$(SP_KIND) $(DP_KIND)

FFLAGS=-g -O2
FPPFLAGS= -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT -DMPI
LDFLAGS=

ARFLAGS_EXTRA=

FCFLAGS_fixed_f=
FCFLAGS_free_f90=
FPPFLAGS_fixed_F=
FPPFLAGS_free_F90=

BLAS_LIBS=-L/opt/intel/composer_xe_2013.1.117/mkl/lib/intel64 -lmkl_blas95_lp64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential  -lmkl_core
LAPACK_LIBS=-L/opt/intel/composer_xe_2013.1.117/mkl/lib/intel64 -lmkl_lapack95_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core
BLACS_LIBS=-L/opt/intel/composer_xe_2013.1.117/mkl/lib/intel64 -lmkl_blacs_openmpi_lp64 #-pthread
SCALAPACK_LIBS=-L/opt/intel/composer_xe_2013.1.117/mkl/lib/intel64 -lmkl_scalapack_lp64 #-pthread

COMP_LIBS=dc_lapack.a

NETCDF_LIBS=
NETCDF_INTERFACE=

LIBS=$(SCALAPACK_LIBS) $(BLACS_LIBS) $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(NETCDF_LIBS)

#SIESTA needs an F90 interface to MPI
#This will give you SIESTA's own implementation
#If your compiler vendor offers an alternative, you may change
#to it here.
MPI_INTERFACE=libmpi_f90.a
MPI_INCLUDE=/opt/openmpi-1.10.1/include

#Dependency rules are created by autoconf according to whether
#discrete preprocessing is necessary or not.
.F.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_fixed_F)  $<
.F90.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_free_F90) $<
.f.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_fixed_f)  $<
.f90.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_free_f90)  $<
赞一下 回复此楼
12楼2016-08-14 11:52:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Alpha s

新虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by guohuazhong at 2016-08-14 11:52:37
不太清楚你的计算机上的编译环境，比如用的是什么版本的fortran编译器，并行环境等等，arch.make看不出什么问题来，另外，你可以在终端中使用 gedit  ~/.bashrc打开.bashrc文件，在文件中加入 ulimit -c unlimited以 ...

嗯。我只是知道我的编译环境应该是用的是gfortran,你的这个arch.make 是siesta-4.0的吗？
赞一下 回复此楼
13楼2016-08-14 14:53:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
13楼: Originally posted by Alpha s at 2016-08-14 14:53:23
嗯。我只是知道我的编译环境应该是用的是gfortran,你的这个arch.make 是siesta-4.0的吗？...

是的，我用的是Intel编译器，并行环境是openmpi

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
14楼2016-08-14 15:23:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Alpha s

新虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by guohuazhong at 2016-08-14 15:23:19
是的，我用的是Intel编译器，并行环境是openmpi
...

嗯，非常感谢你的回答，我再好好研究研究吧！
赞一下 回复此楼
15楼2016-08-15 10:06:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Alpha s 的主题更新
152/2返回列表上一页12
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗？ +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 8/400 2026-09-01 12:58 by ssyjh
[基金申请] 面上函评意见出来了，像什么等级？ 20+4 Tsingking1 2026-08-27 15/750 2026-09-01 12:23 by icm639
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 国社科又开始会评了，不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +6 yuleib84 2026-08-26 7/350 2026-08-31 19:46 by 鱼翔浅底1
[基金申请] 为什么到现在没收到通知？ +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭