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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 用MPICH3.2, BLACS,LAPACK.SCALAPACK安装siesta
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Alpha s

新虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by guohuazhong at 2016-08-12 18:31:41
贴出你的arch.make文件吧...

你帮我看看，是不是arch.make文件有问题呢，
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11楼2016-08-13 20:37:21
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guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
Alpha s: 金币+50, ★★★很有帮助 2016-08-15 10:06:50
蛋蛋小童鞋: 金币+2, 谢谢参与，鼓励积极回答问题者 2016-08-15 10:15:56
不太清楚你的计算机上的编译环境，比如用的是什么版本的fortran编译器，并行环境等等，arch.make看不出什么问题来，另外，你可以在终端中使用 gedit  ~/.bashrc打开.bashrc文件，在文件中加入 ulimit -c unlimited以及ulimit -s umlimited 试试

下面是我的arch.make,你可以参考一下，重点是你要修改库文件以适合你自己电脑上的所安装的库
#
# This file is part of the SIESTA package.
#
# Copyright (c) Fundacion General Universidad Autonoma de Madrid:
# E.Artacho, J.Gale, A.Garcia, J.Junquera, P.Ordejon, D.Sanchez-Portal
# and J.M.Soler, 1996- .
#
# Use of this software constitutes agreement with the full conditions
# given in the SIESTA license, as signed by all legitimate users.
#
.SUFFIXES:
.SUFFIXES: .f .F .o .a .f90 .F90

SIESTA_ARCH=x86_64-unknown-linux-gnu--unknown

FPP=
FPP_OUTPUT=
FC=mpif90
RANLIB=ranlib

SYS=nag

SP_KIND=4
DP_KIND=8
KINDS=$(SP_KIND) $(DP_KIND)

FFLAGS=-g -O2
FPPFLAGS= -DFC_HAVE_FLUSH -DFC_HAVE_ABORT -DMPI
LDFLAGS=

ARFLAGS_EXTRA=

FCFLAGS_fixed_f=
FCFLAGS_free_f90=
FPPFLAGS_fixed_F=
FPPFLAGS_free_F90=

BLAS_LIBS=-L/opt/intel/composer_xe_2013.1.117/mkl/lib/intel64 -lmkl_blas95_lp64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential  -lmkl_core
LAPACK_LIBS=-L/opt/intel/composer_xe_2013.1.117/mkl/lib/intel64 -lmkl_lapack95_lp64 -lmkl_sequential -lmkl_core
BLACS_LIBS=-L/opt/intel/composer_xe_2013.1.117/mkl/lib/intel64 -lmkl_blacs_openmpi_lp64 #-pthread
SCALAPACK_LIBS=-L/opt/intel/composer_xe_2013.1.117/mkl/lib/intel64 -lmkl_scalapack_lp64 #-pthread

COMP_LIBS=dc_lapack.a

NETCDF_LIBS=
NETCDF_INTERFACE=

LIBS=$(SCALAPACK_LIBS) $(BLACS_LIBS) $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(NETCDF_LIBS)

#SIESTA needs an F90 interface to MPI
#This will give you SIESTA's own implementation
#If your compiler vendor offers an alternative, you may change
#to it here.
MPI_INTERFACE=libmpi_f90.a
MPI_INCLUDE=/opt/openmpi-1.10.1/include

#Dependency rules are created by autoconf according to whether
#discrete preprocessing is necessary or not.
.F.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_fixed_F)  $<
.F90.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FPPFLAGS) $(FPPFLAGS_free_F90) $<
.f.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_fixed_f)  $<
.f90.o:
        $(FC) -c $(FFLAGS) $(INCFLAGS) $(FCFLAGS_free_f90)  $<
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12楼2016-08-14 11:52:37
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Alpha s

新虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by guohuazhong at 2016-08-14 11:52:37
不太清楚你的计算机上的编译环境，比如用的是什么版本的fortran编译器，并行环境等等，arch.make看不出什么问题来，另外，你可以在终端中使用 gedit  ~/.bashrc打开.bashrc文件，在文件中加入 ulimit -c unlimited以 ...

嗯。我只是知道我的编译环境应该是用的是gfortran,你的这个arch.make 是siesta-4.0的吗？
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13楼2016-08-14 14:53:23
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guohuazhong

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
13楼: Originally posted by Alpha s at 2016-08-14 14:53:23
嗯。我只是知道我的编译环境应该是用的是gfortran,你的这个arch.make 是siesta-4.0的吗？...

是的，我用的是Intel编译器，并行环境是openmpi

发自小木虫Android客户端
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14楼2016-08-14 15:23:19
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Alpha s

新虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by guohuazhong at 2016-08-14 15:23:19
是的，我用的是Intel编译器，并行环境是openmpi
...

嗯，非常感谢你的回答，我再好好研究研究吧！
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15楼2016-08-15 10:06:21
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