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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 化学化工区 » 分析 » 质谱分析 » 关于蛋白质质谱结果的分析
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wyanyun

铁虫 (初入文坛)

[求助] 关于蛋白质质谱结果的分析 已有1人参与

各位大侠：
本人之前的课题是希望能找出人的某种体液中的特异蛋白质（即A样本中存在，而B样本中不存在），所以将2样本送至公司做了全蛋白质谱分析（仪器是triple TOF 5600），结果回来后发现A样本中有500多个蛋白在B样本中都不存在。现在的问题是如果我需要进行后续的大样本量的定量检测，该如何选择检测蛋白呢？我不可能把500多个蛋白全部都做一遍，有没有什么选择的秘诀之类的。目前拿到的数据除了原始的raw，mgf文件，就是公司给出的分析数据，包括Protein Mass，Coverage，Isoelectric Point，        # of unique peptide，        # of unique spectrum，# of spectrum。实在是不知道该怎么进行下一步了，请各位帮忙！
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1楼 2016-08-10 21:18:34
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jiafeijiafei

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

可以找和你课题相关的蛋白或者有相关文献报道的蛋白，感兴趣的就行
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2楼2016-08-26 17:19:07
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JLU_chem_man

新虫 (正式写手)

质谱蛋白质学习者
500多个蛋白？不知道鉴定结果咋样，质谱数据的覆盖率啥的有没有问题
赞一下 回复此楼
努力奋斗！！！
3楼2016-09-07 11:54:14
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