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seven9870

新虫 (小有名气)

[求助] 我的系统发育树是哪个步骤出了问题,为什么看起来不太对? 已有1人参与

为什么跟大家建的树不一样呢,好像是在选相似序列的时候出了问题,为什么我的菌是单独的一个分支?
我主要选有文献报道过的、相似度在96%以上的序列,这样对吗?
请求帮助!!谢谢大家!

我的系统发育树是哪个步骤出了问题,为什么看起来不太对?
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-11 07:57:51
seven9870: 金币+20, 有帮助 2016-09-01 20:36:23
1.选择参比序列时,不要选相似性都特别高的,如果序列相似性都特别高,建出的树分支短且不准确。
2.你的菌单独成支且距离远的原因应该是你的序列方向问题,把你的序列反向互补后,再与其他序列一起建树看看。
2楼2016-08-10 12:39:36
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