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DNA片段打靶,PCR验证既有目的条带也有野生型条带
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| 构建了RecET同源重组系统,用DNA片段打靶(含双侧同源臂及kan标签),kan抗性筛选平皿长了好多菌,用目的片段外围引物与kan标签内引物组合,扩增几乎100%阳性。且上下游的外围引物与kan标签组合均有阳性条带,说明DNA片段成功插入染色体,且位置正确。但如果用同源臂内部引物扩增却是双条带,既有目的片段,又有野生型条带。反复挑单克隆传代5次,结果依旧。目的基因为单拷贝,不明白为什么出现这个情况,难道细菌可以有异源双链稳定存在?不理解!。另外,所有鉴定都是用的菌落PCR,反复传代都到8代了,难道还会有DNA污染?不知道哪里出了问题。有没有遇到过这个情况的敬请赐教! |
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