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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】请教Linux下如何写输入文件（没解决，继续向大家请教）
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basanwuyu

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】请教Linux下如何写输入文件（没解决，继续向大家请教）

向老师们请教：

     我们学校有高性能计算中心，是Linux环境的，我写的G03输入文件，提交上去总是算一会儿就出错了，我基本上是按Windows下形式写的，然后也转换了格式的，这是我在Windows下写的，然后再转了一下格式

%mem=200MB
%nproc=4
#p b3lyp/gen pseudo=read opt freq

Title Card Required

0 3
Pd
Pd                 1              B1
Pd                 2              B2    1              A1
Pd                 3              B3    2              A2    1              D1
Pd                 3              B4    2              A3    1              D2
Pd                 3              B5    2              A4    1              D3
Pd                 1              B6    2              A5    3              D4
Pd                 7              B7    1              A6    2              D5

   B1             2.17909968
   B2             2.14902937
   B3             2.37666636
   B4             2.39670889
   B5             1.95722840
   B6             2.07568556
   B7             1.88926880
   A1           112.56280782
   A2            63.68991143
   A3            63.64328232
   A4           122.37474790
   A5           122.98563585
   A6           111.95508879
   D1           -40.58239553
   D2            41.01470494
   D3             2.42859553
   D4            -2.08261421
   D5             1.22348181

Pd 0
lanl2dz
*****

Pd 0
lanl2dz
请问正确的写法是：
          谢谢！

[ Last edited by basanwuyu on 2008-11-15 at 09:03 ]
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谋事在人，成事在人；为梦想奋斗，永不停息！
1楼 2008-11-14 10:46:55
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zyy816

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
basanwuyu(金币+1,VIP+0):谢谢你！
你把出错信息贴出来吗，按照道理，ｗｉｎｄｏｗｓ下面能够运行，然后在ｌｉｎｕｘ下转化一下格式就可以运行，不会有什么问题的。
赞一下(14人) 回复此楼
2楼2008-11-14 11:16:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

recoli

金虫 (正式写手)
★ ★
basanwuyu(金币+2,VIP+0):感谢你的回答！
文件末尾空两行
回复此楼
3楼2008-11-17 13:53:11
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abbott

金虫 (著名写手)

不要用QQ问我东西
★ ★ ★ ★ ★ ★
zzgyb(金币+3,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
basanwuyu(金币+3,VIP+0):感谢abbott 的回答！
为什么不直接在vi下进行编辑？

自己非要找麻烦干什么呢？

vi编辑器多好用啊！

你如果是想喜欢用win-xp平台
可以这样
安装UltraEdite
选择保存文件格式为分行符号为：UNIX
编码 UTF-8
就没有问题了。

至于输入文件的格式，这个不用多数了吧，高斯的说明书有的。
或者看gaussian.com看在线手册

[ Last edited by abbott on 2008-11-17 at 14:53 ]
赞一下(13人) 回复此楼
Chemistry[]==[]Chem[]is[]try!!!
4楼2008-11-17 14:51:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaogang06

铁虫 (小有名气)
★ ★
basanwuyu(金币+2,VIP+0): 感谢你的回答！
引用回帖:
Originally posted by recoli at 2008-11-17 13:53:
文件末尾空两行

同意，估计是这个原因。楼主可以试下
赞一下(3人) 回复此楼
5楼2008-11-17 18:27:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ljfyf

铜虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎再次光临计算模拟版！
basanwuyu(金币+2,VIP+0):感谢你的回答！
在windows下用editplus等编辑好的文件直接放到linux上计算是会报错的，楼主可以在linux上vi文件名之后把一楼的东西粘贴过去保存在计算应该就可以了。
我也出过同样的问题
赞一下(12人) 回复此楼
6楼2008-11-18 08:54:18
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