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sdzll

铁杆木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】dmol3的计算问题

1、在计算的时候,先用coarse精度算,再用fine算的时候,是不是coarse的时候先不用选properties,等用fine精度算的时候再把要算的性质选上啊?
2、还有就是我算的时候怎么老算到39轮左右的时候就卡住不动了,怎么回事啊?
3、顺便请教一下虚频怎么看啊?是不是什么的值是负值就是虚频啊~,有虚频是不是这种结构就不大可能存在啊?
大侠们请指教啊!谢谢
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辰锦
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zhengjinde

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zzgyb(金币+3,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
sdzll(金币+5,VIP+0):谢谢你,我说的卡住是指迭代到某一步之后,譬如说39步,一连两三天那个收敛曲线一直停在那一步上,没有弹出任何信息,不知道是怎么回事?
1 你有coarse应该是做测试计算的,按理是可以不选properties
2.我不知道你描述的卡住是什么意思,是指死机还是计算失败之类.如果是计算失败,建议将自洽场轮数改大
3.虚频就是指振动波数为负,如果是分子体系,应该是无虚频率.周期体系的话,虚频多,就说明你未找到能量最小的结构(最稳定结构)吧
希望对你有所帮助

[ Last edited by zhengjinde on 2008-11-14 at 13:39 ]
2楼2008-11-14 10:52:24
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zhengjinde

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与
sdzll(金币+5,VIP+0):对您的帮助再次表示感谢!
你说的卡住是指迭代到某一步之后,譬如说39步,一连两三天那个收敛曲线一直停在那一步上,没有弹出任何信息.

先检查下,内存和cpu使用情况,看看会不会是机子资源紧张; 也可以把outmol弄回来看看,到底机器还有没有在计算.
还有一种可能就是计算的体系过大(原子数超过200,计算起来都是比较吃力的)
当然也不排除已经计算完了,在转入计算性质比方说频率也有可能出现你说的那种情况的
3楼2008-11-14 16:15:04
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sdzll

铁杆木虫 (著名写手)

我的模型是175个原子,服务器是双核的,我师姐算fluent,我算MS,可能是资源紧张吧,而且我勾上了6个properties,也可能是我的模型画的不好的事吧,总之原因我也说不清楚了。
对您的帮助再次表示感谢!
辰锦
4楼2008-11-14 17:01:36
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58153365

铜虫 (小有名气)

天啊,双核的服务器算175个原子,太夸张了吧
5楼2008-11-14 19:31:29
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aaq2800

铁杆木虫 (知名作家)

这么多的原子,光频率分析这一项就够算半个月的

[ Last edited by aaq2800 on 2008-11-15 at 08:36 ]
6楼2008-11-14 20:19:56
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sdzll

铁杆木虫 (著名写手)

啊,我是初学MS,不知道啊,我算电荷密度和静电势挺快的啊,大约4天吧,是不是频率格外的耗时啊?
辰锦
7楼2008-11-14 21:30:17
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