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fengguanfeng

木虫 (初入文坛)

[求助] 求助石墨烯上水滴模拟的data文件 已有2人参与

单独石墨烯的data文件知道怎么生成,加上水滴后,整体的data文件该怎么生成呢?尤其是水分子初始位移的分布。看到一些文献说悬空的石墨烯上加水滴,由于水滴对石墨烯的作用,石墨烯结构会被破坏,所以要加基底研究。而有的文献确实是研究的单层石墨烯上加水滴的情况,前提是石墨烯要固定,我自己的理解是为了不让石墨烯结构破坏,人为地让c原子不振动,相对位移为0,这样的理解对吗?
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alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
整体的data文件的生成,moltemplate可以帮你解决。
2楼2016-08-04 04:54:12
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fengguanfeng

木虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-08-04 04:54:12
整体的data文件的生成,moltemplate可以帮你解决。

好的,谢谢您的回复!
never give up
3楼2016-08-04 18:39:12
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scutxl

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
fengguanfeng: 金币+3, 谢谢您的回复! 2016-08-23 09:51:33
这个可以用VMD去构建,extension/modeling/里面有可以构建石墨烯,碳纳米管等基地,之后再modeling里面可以直接构建水环境,你只需要通过简单的tcl脚本就可以转换为data文件了。
4楼2016-08-19 22:04:43
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