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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 求助石墨烯上水滴模拟的data文件
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fengguanfeng

木虫 (初入文坛)

[求助] 求助石墨烯上水滴模拟的data文件 已有2人参与

单独石墨烯的data文件知道怎么生成，加上水滴后，整体的data文件该怎么生成呢？尤其是水分子初始位移的分布。看到一些文献说悬空的石墨烯上加水滴，由于水滴对石墨烯的作用，石墨烯结构会被破坏，所以要加基底研究。而有的文献确实是研究的单层石墨烯上加水滴的情况，前提是石墨烯要固定，我自己的理解是为了不让石墨烯结构破坏，人为地让c原子不振动，相对位移为0，这样的理解对吗？
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never give up
1楼 2016-08-03 08:54:48
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alundilong

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
整体的data文件的生成，moltemplate可以帮你解决。
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2楼2016-08-04 04:54:12
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fengguanfeng

木虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by alundilong at 2016-08-04 04:54:12
整体的data文件的生成，moltemplate可以帮你解决。

好的，谢谢您的回复！
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never give up
3楼2016-08-04 18:39:12
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scutxl

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
fengguanfeng: 金币+3, 谢谢您的回复！ 2016-08-23 09:51:33
这个可以用VMD去构建，extension/modeling/里面有可以构建石墨烯，碳纳米管等基地，之后再modeling里面可以直接构建水环境，你只需要通过简单的tcl脚本就可以转换为data文件了。
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4楼2016-08-19 22:04:43
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