应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » ms建模
51/1返回列表
查看: 1070  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

KBzml

铁虫 (小有名气)

[求助] ms建模 已有1人参与

1.利用MS中导入的晶胞为原型，构建纳米压头的几何模型，模型图如下
2.MS中是否和自编程，随意根据提供的晶胞进行空间重复和几何求和、求差、求交来构建模型，即删除不想要的原子可不可以通过编程筛选而非手动

ms建模
模型图.png


ms建模-1
my_CuZn_晶胞.png


ms建模-2
my_CuZn.png@oxox6085
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2016-07-29 17:57:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

MS_Z

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

实际上只要有坐标信息就能完成MS建模，这样就是通过xyz文件导入进行建模。
xyz文件可以根据你的要求通过编程写出来。
xyz文件的具体格式是：第一行为总原子个数，其余各行第一列为原子名称（Cu Zn这一类） 后面三列为x y z坐标。
当然这样的方法你可能需要了解Cu Zn的晶胞排布。
不知道对你是否能有所帮助
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

KBzml
2楼2016-08-02 10:08:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KBzml

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by MS_Z at 2016-08-02 10:08:21
实际上只要有坐标信息就能完成MS建模，这样就是通过xyz文件导入进行建模。
xyz文件可以根据你的要求通过编程写出来。
xyz文件的具体格式是：第一行为总原子个数，其余各行第一列为原子名称（Cu Zn这一类） 后面三 ...

我最终是想获得该模型的data文件，导入lammps计算，如果是你说的，是不是直接可以通过编程实现几何模型的构建

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2016-08-10 15:47:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KBzml

铁虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by MS_Z at 2016-08-02 10:08:21
实际上只要有坐标信息就能完成MS建模，这样就是通过xyz文件导入进行建模。
xyz文件可以根据你的要求通过编程写出来。
xyz文件的具体格式是：第一行为总原子个数，其余各行第一列为原子名称（Cu Zn这一类） 后面三 ...

你好，这个模型我基本可以用ms构建出来了，当然谢谢你提的方案

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2016-08-10 22:24:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

MS_Z

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by KBzml at 2016-08-10 15:47:05
我最终是想获得该模型的data文件，导入lammps计算，如果是你说的，是不是直接可以通过编程实现几何模型的构建
...

嗯 是的

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
5楼2016-08-11 09:45:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 KBzml 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭