应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » ms建模
51/1返回列表
查看: 1067  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

KBzml

铁虫 (小有名气)

[求助] ms建模 已有1人参与

1.利用MS中导入的晶胞为原型，构建纳米压头的几何模型，模型图如下
2.MS中是否和自编程，随意根据提供的晶胞进行空间重复和几何求和、求差、求交来构建模型，即删除不想要的原子可不可以通过编程筛选而非手动

ms建模
模型图.png


ms建模-1
my_CuZn_晶胞.png


ms建模-2
my_CuZn.png@oxox6085
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2016-07-29 17:57:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

MS_Z

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

实际上只要有坐标信息就能完成MS建模，这样就是通过xyz文件导入进行建模。
xyz文件可以根据你的要求通过编程写出来。
xyz文件的具体格式是：第一行为总原子个数，其余各行第一列为原子名称（Cu Zn这一类） 后面三列为x y z坐标。
当然这样的方法你可能需要了解Cu Zn的晶胞排布。
不知道对你是否能有所帮助
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

KBzml
2楼2016-08-02 10:08:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KBzml

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by MS_Z at 2016-08-02 10:08:21
实际上只要有坐标信息就能完成MS建模，这样就是通过xyz文件导入进行建模。
xyz文件可以根据你的要求通过编程写出来。
xyz文件的具体格式是：第一行为总原子个数，其余各行第一列为原子名称（Cu Zn这一类） 后面三 ...

我最终是想获得该模型的data文件，导入lammps计算，如果是你说的，是不是直接可以通过编程实现几何模型的构建

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2016-08-10 15:47:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KBzml

铁虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by MS_Z at 2016-08-02 10:08:21
实际上只要有坐标信息就能完成MS建模，这样就是通过xyz文件导入进行建模。
xyz文件可以根据你的要求通过编程写出来。
xyz文件的具体格式是：第一行为总原子个数，其余各行第一列为原子名称（Cu Zn这一类） 后面三 ...

你好，这个模型我基本可以用ms构建出来了，当然谢谢你提的方案

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2016-08-10 22:24:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

MS_Z

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by KBzml at 2016-08-10 15:47:05
我最终是想获得该模型的data文件，导入lammps计算，如果是你说的，是不是直接可以通过编程实现几何模型的构建
...

嗯 是的

发自小木虫IOS客户端
回复此楼
5楼2016-08-11 09:45:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 KBzml 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 l7k6xnh0yc 2026-05-14 7/350 2026-05-16 23:17 by ue3ir18jc3
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 l7k6xnh0yc 2026-05-14 5/250 2026-05-16 23:05 by ue3ir18jc3
[基金申请] 请问大佬b0816评完了吗 +4 市民华南虎 2026-05-12 8/400 2026-05-16 19:54 by Equinoxhua
[高分子] 本人最近太闲了，谁有问题可以提，每天会统一回复 +9 一切都是空工 2026-05-12 20/1000 2026-05-16 19:52 by Equinoxhua
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ky2p12rrjj 2026-05-15 4/200 2026-05-16 18:45 by j6b2pdz07o
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ky2p12rrjj 2026-05-15 3/150 2026-05-16 18:35 by j6b2pdz07o
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 x0mp7owy2b 2026-05-15 3/150 2026-05-16 17:50 by j6b2pdz07o
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 x0mp7owy2b 2026-05-15 4/200 2026-05-16 17:45 by j6b2pdz07o
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 v9tggjlwd0 2026-05-15 3/150 2026-05-16 17:37 by j6b2pdz07o
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 v9tggjlwd0 2026-05-15 3/150 2026-05-16 17:30 by j6b2pdz07o
[考博] 光量子物理方向 博士招生 1人（2026.09） +3 sandyworld 2026-05-15 3/150 2026-05-16 17:11 by zznnnj
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 cjf4bx70cj 2026-05-14 6/300 2026-05-16 16:17 by 0i5p09z61n
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 k37jurhrau 2026-05-16 3/150 2026-05-16 13:57 by vcdazktkjx
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 l7k6xnh0yc 2026-05-14 6/300 2026-05-16 11:29 by h3oerqvkv9
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 cjf4bx70cj 2026-05-14 6/300 2026-05-16 11:16 by h3oerqvkv9
[考博] 2026博士还有哪些学校有名额 +5 小王求读研 2026-05-15 6/300 2026-05-16 10:44 by a4742549
[考博] 西南大学考核制博士 +4 lijunjie84 2026-05-11 7/350 2026-05-15 23:20 by 同仁堂教主
[文学芳草园] 风把牡丹吹跑了 +5 myrtle 2026-05-12 9/450 2026-05-15 15:27 by myrtle
[基金申请] 青C资助名额大幅增加！ +11 西葫芦炒鸡蛋 2026-05-13 15/750 2026-05-15 14:36 by ambravo
[教师之家] 教学课件你会给同学吗 +8 硕士研究生吗 2026-05-13 8/400 2026-05-14 22:23 by 常规沥青
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭