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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » ms建模
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KBzml

铁虫 (小有名气)

[求助] ms建模 已有1人参与

1.利用MS中导入的晶胞为原型，构建纳米压头的几何模型，模型图如下
2.MS中是否和自编程，随意根据提供的晶胞进行空间重复和几何求和、求差、求交来构建模型，即删除不想要的原子可不可以通过编程筛选而非手动

ms建模
模型图.png


ms建模-1
my_CuZn_晶胞.png


ms建模-2
my_CuZn.png@oxox6085
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1楼 2016-07-29 17:57:50
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MS_Z

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

实际上只要有坐标信息就能完成MS建模，这样就是通过xyz文件导入进行建模。
xyz文件可以根据你的要求通过编程写出来。
xyz文件的具体格式是：第一行为总原子个数，其余各行第一列为原子名称（Cu Zn这一类） 后面三列为x y z坐标。
当然这样的方法你可能需要了解Cu Zn的晶胞排布。
不知道对你是否能有所帮助
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

KBzml
2楼2016-08-02 10:08:21
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KBzml

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by MS_Z at 2016-08-02 10:08:21
实际上只要有坐标信息就能完成MS建模，这样就是通过xyz文件导入进行建模。
xyz文件可以根据你的要求通过编程写出来。
xyz文件的具体格式是：第一行为总原子个数，其余各行第一列为原子名称（Cu Zn这一类） 后面三 ...

我最终是想获得该模型的data文件，导入lammps计算，如果是你说的，是不是直接可以通过编程实现几何模型的构建

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3楼2016-08-10 15:47:05
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KBzml

铁虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by MS_Z at 2016-08-02 10:08:21
实际上只要有坐标信息就能完成MS建模，这样就是通过xyz文件导入进行建模。
xyz文件可以根据你的要求通过编程写出来。
xyz文件的具体格式是：第一行为总原子个数，其余各行第一列为原子名称（Cu Zn这一类） 后面三 ...

你好，这个模型我基本可以用ms构建出来了，当然谢谢你提的方案

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4楼2016-08-10 22:24:29
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MS_Z

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by KBzml at 2016-08-10 15:47:05
我最终是想获得该模型的data文件，导入lammps计算，如果是你说的，是不是直接可以通过编程实现几何模型的构建
...

嗯 是的

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5楼2016-08-11 09:45:14
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