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hongzhangyu

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助 关于转录组测序 扩增序列

对转录组中测得的片段进行PCR扩增,换了很多引物,扩增条件,都没有扩增到,序列和本物种其他转录组比对后相似度100%,不知道是什么原因?  求助各位大神,在线等!!!
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soarrow

铁杆木虫 (正式写手)

酱油歪楼党

拿进行转录组测序的原始样本RNA或者当时构建的cDNA文库试试呗

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2楼2016-08-01 02:00:30
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hongzhangyu

铁虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by soarrow at 2016-08-01 02:00:30
拿进行转录组测序的原始样本RNA或者当时构建的cDNA文库试试呗

当时的样本 已经没有了

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-08-01 07:51:05
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soarrow

铁杆木虫 (正式写手)

酱油歪楼党

引用回帖:
3楼: Originally posted by hongzhangyu at 2016-08-01 07:51:05
当时的样本 已经没有了
...

这种事情也常见,RNA-Seq出来的序列,未必能够顺利扩增出来
主要可能在于两个方面,
一方面是数据拼接的可靠性,以及对应序列的深度
一方面可能是靶序列含量很低,引物扩增的灵敏度不够
总之,这是很头疼的事情

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2016-08-01 22:00:31
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5楼2016-08-01 22:27:35
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hongzhangyu

铁虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by soarrow at 2016-08-01 22:00:31
这种事情也常见,RNA-Seq出来的序列,未必能够顺利扩增出来
主要可能在于两个方面,
一方面是数据拼接的可靠性,以及对应序列的深度
一方面可能是靶序列含量很低,引物扩增的灵敏度不够
总之,这是很头疼的事情...

谢谢    做了很久  换了几次引物  终于做出来了几个

发自小木虫IOS客户端
6楼2016-08-02 07:52:52
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