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雨蝶飛

银虫 (小有名气)

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[求助] 在高斯优化得到这样的结果，是怎么回事啊，新手，求大神指点，这是.log文件的最后几行已有1人参与

nuclear repulsion energy    6402.5661312901 Hartrees.
NAtoms= 50 NActive= 50 NUniq= 50 SFac= 1.00D+00 NAtFMM= 60 NAOKFM=F Big=F
Integral buffers will be 131072 words long.
Raffenetti 2 integral format.
Two-electron integral symmetry is turned on.
One-electron integrals computed using PRISM.
NBasis= 983 RedAO= T EigKep=  1.17D-06  NBF= 983
NBsUse= 977 1.00D-06 EigRej=  9.49D-07 NBFU= 977
Initial guess from the checkpoint file:  "Zn-MOF-74-jietu.chk"
B after Tr=    0.000000 0.000000 0.000000
      Rot= 0.999991 0.001178 0.002908 -0.002722 Ang= 0.48 deg.
Initial guess <Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 0.5000 <S**2>= 3.1395 S= 1.3411
ExpMin= 1.53D-02 ExpMax= 3.16D+05 ExpMxC= 1.12D+04 IAcc=3 IRadAn=       5 AccDes= 0.00D+00
Harris functional with IExCor=  402 and IRadAn=    5 diagonalized for initial guess.
HarFok:  IExCor=  402 AccDes= 0.00D+00 IRadAn=       5 IDoV= 1 UseB2=F ITyADJ=14
ICtDFT=  3500011 ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000
FoFCou: FMM=F IPFlag=          0 FMFlag=    100000 FMFlg1=          0
      NFxFlg=          0 DoJE=T BraDBF=F KetDBF=T FulRan=T
      wScrn=  0.000000 ICntrl=    500 IOpCl=  0 I1Cent= 200000004 NGrid=          0
      NMat0= 1 NMatS0=    1 NMatT0= 0 NMatD0= 1 NMtDS0= 0 NMtDT0= 0
Petite list used in FoFCou.
Requested convergence on RMS density matrix=1.00D-08 within 299 cycles.
Requested convergence on MAX density matrix=1.00D-06.
Requested convergence on          energy=1.00D-06.
No special actions if energy rises.
Restarting incremental Fock formation.

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1楼 2016-07-26 09:24:20

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雨蝶飛

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12楼: Originally posted by gauss98 at 2016-07-26 21:54:23
晶体里的结构是周期性的，里边显示的端氧其实是多配位的，单纯截出来氧就只有这个配位了

你现在要么用周期性条件做
如果要截出来当成分子做，
一个近似的方法是将端基氧做饱和处理，比如增加一个 -H 或者-C ...

那加H或CH3会改变原有的结构吗？你指的是露在最外端的氧？

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13楼2016-07-27 10:24:56

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gauss98

禁虫 (正式写手)

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2楼2016-07-26 14:28:57

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2楼: Originally posted by gauss98 at 2016-07-26 14:28:57
你这是SCF没有收敛吧？
初始结构不合理？多重度太多？

把输入文件看看

%chk=Zn-MOF-74-jietu.chk
%mem=4GB
%NProcShared=8
#B3LYP/6-311++G(d,p) OPT SCF=(MaxCycle=299) Freq=NoRaman

Zn-MOF-74-jietu

0 2
H                -3.20040000 8.76950000 0.90180000
H                1.65040000 3.92830000 3.74440000
C                -3.00720000 9.35910000 1.79420000
C                1.24830000 2.92870000 5.59850000
H                1.41480000 1.94430000 5.04830000
C                1.48570000 4.05950000 4.81050000
O                0.09060000 5.28270000 2.18500000
O                1.57080000 8.21560000 1.92890000
O                -1.06930000 8.06530000 2.11470000
Zn                0.40580000 7.06490000 3.09190000
H                -2.33640000 11.44720000 4.96140000
C                -0.48860000 9.61080000 4.63180000
H                -1.03460000 10.18480000 5.45150000
C                -1.63850000 9.83300000 3.73520000
C                -2.52950000 10.85760000 4.06900000
C                -3.66650000 11.16010000 3.30980000
H                -4.35230000 11.99790000 3.66660000
C                -3.89820000 10.38370000 2.12800000
H                -4.66300000 10.76320000 1.37250000
C                -1.87030000 9.05660000 2.55340000
O                0.29260000 8.61190000 4.37740000
O                3.36830000 8.55480000 3.19060000
O                1.72230000 6.37450000 4.46470000
H                4.35110000 10.84210000 3.90320000
C                6.67940000 11.38730000 6.35550000
H                7.69730000 11.83480000 6.60690000
C                1.51550000 5.36050000 5.32850000
C                6.10320000 11.31320000 5.04540000
H                6.60250000 11.60760000 4.32360000
C                4.78040000 10.88300000 4.90080000
C                3.98010000 10.49190000 5.98150000
O                -0.17460000 10.48060000 6.44700000
O                2.73040000 10.06380000 5.71410000
Zn                2.22410000 8.31010000 4.84040000
H                0.91100000 4.51570000 8.59260000
H                6.30840000 11.03710000 8.43380000
C                1.33490000 6.82590000 7.41560000
H                0.89400000 6.90410000 8.46400000
C                1.31300000 5.51530000 6.73850000
C                1.07570000 4.38440000 7.52650000
C                1.04580000 3.08350000 7.00850000
H                0.70410000 2.22180000 7.67210000
C                3.81960000 10.20250000 8.51720000
H                4.39600000 10.38280000 9.48410000
C                4.55620000 10.56610000 7.29160000
C                5.87910000 10.99630000 7.43620000
O                1.62540000 7.87010000 6.71000000
O                2.57290000 9.87820000 8.40280000
O                -0.06720000 9.72790000 8.58850000
Zn                1.15530000 9.80530000 6.97500000

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3楼2016-07-26 16:11:37

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