应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 求助 （已知遗传距离矩阵，怎么进行聚类分析）
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
71/1返回列表
查看: 2464  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

蔓菁

金虫 (正式写手)

[交流] 求助 （已知遗传距离矩阵，怎么进行聚类分析）

已知遗传距离矩阵：
如Genotype 全矩阵：
              2410          32_           4484             4594          4607            4632
2410        0.0000        0.8990        1.1882        1.1626        1.1843        1.2103
32_           0.8990        0.0000        0.6783        0.7261        0.9291        1.0177
4484        1.1882        0.6783        0.0000        0.2009        0.4018        0.2703
4594        1.1626        0.7261        0.2009        0.0000        0.2641        0.1736
4607        1.1843        0.9291        0.4018        0.2641        0.0000        0.2181
4632        1.2103        1.0177        0.2703        0.1736        0.2181        0.0000

或者半矩阵：
                   V2410                       V4484                        Bogra            Cypress
V2410        0                       
V4484        0.657608696        0               
Bogra        0.575688073        0.552197802        0       
Cypress        0.860294118        0.885057471        0.919117647        0

请问用什么软件进行聚类分析？
SAS？ DARwin？ 还是NTSYS pc？

请大侠赐教！

谢谢
我的email是 mhuang@cgiar.org

[ Last edited by 蔓菁 on 2008-11-13 at 10:44 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2008-11-12 20:43:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蔓菁

金虫 (正式写手)
怎么没有人理睬啊？唔唔唔唔唔唔唔……
赞一下 回复此楼
2楼2008-11-13 10:45:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chibingjie

我只会用mega4聚类，你试试。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2008-11-13 16:01:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蔓菁

金虫 (正式写手)
没用过  好用不?

谢谢
赞一下 回复此楼
4楼2008-11-13 16:30:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shinevip

木虫 (正式写手)
matlab聚类还不错

[ Last edited by shinevip on 2008-11-13 at 20:05 ]
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2008-11-13 19:45:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蔓菁

金虫 (正式写手)
请问有使用说明书不？  怎么将我发的那种矩阵做聚类分析？

谢谢
赞一下 回复此楼
6楼2008-11-13 20:35:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shinevip

木虫 (正式写手)
编过这方面的一个小程序,就用你的数据画了上面的图.
但不清楚其它生物信息学软件用的什么算法.
赞一下 回复此楼
7楼2008-11-13 20:50:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 蔓菁 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料专硕(0856) 339分求调剂 +9 哈哈哈鹅哈哈哈 2026-04-05 9/450 2026-04-05 22:24 by dongzh2009
[考研] 272分求调剂 +4 wangyile2233 2026-04-02 4/200 2026-04-05 22:21 by 286640313
[考研] 材料专硕283求调剂 +14 试试看呗 2026-04-04 15/750 2026-04-05 19:21 by jkddd
[考研] 298求调剂 +3 manman511 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:09 by kk112233
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358求调剂 +6 cs0106 2026-04-05 6/300 2026-04-05 16:34 by imissbao
[有机交流] 甲醇/二氯 1:15过柱子 5+3 a哎y呦w喂 2026-03-31 3/150 2026-04-05 10:42 by 88817753
[考研] 求调剂 +3 电气小神童 2026-04-04 3/150 2026-04-05 10:17 by barlinike
[考研] 083200 333求调剂 +3 十二！！ 2026-04-04 3/150 2026-04-05 08:28 by barlinike
[考研] 291求调剂 +4 迷蒙木木 2026-04-01 5/250 2026-04-04 15:59 by sihailian3
[考研] 求调剂 +4 压力??大 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:36 by 啵啵啵0119
[考研] 一志愿华中农业071010，总分320求调剂 +7 困困困困坤坤 2026-04-02 7/350 2026-04-03 17:26 by Yuena_Wang
[考研] 316求调剂 +14 舟自梗 2026-04-01 18/900 2026-04-03 10:28 by linyelide
[考研] 309求调剂 +14 呆菇不是戴夫 2026-04-02 14/700 2026-04-03 09:42 by 蓝云思雨
[考研] 085602化工求调剂（331分） +9 111@127 2026-03-30 9/450 2026-04-02 20:00 by dick_runner
[考研] 一志愿华南师范大学-22408计算机-292分-求华南师范大学调剂 +4 爱读书的小鳄鱼 2026-04-02 4/200 2026-04-02 18:35 by 求调剂zz
[考研] 【求调剂】新能源材料本科，一志愿211，初试321 +6 求调剂学校， 2026-04-02 6/300 2026-04-02 09:41 by 晴空210210
[考研] 085600，321分求调剂 +13 大馋小子 2026-03-31 13/650 2026-04-01 12:35 by chemdavid
[考研] 301求调剂 +8 axibli 2026-04-01 8/400 2026-04-01 09:51 by 我的船我的海
[考研] 一志愿西电085401数一英一299求调剂 六级521 +4 爱吃大鸭梨 2026-03-31 4/200 2026-03-31 11:51 by 搏击518
[考研] 297 地理学070500 复试求调剂 +3 小圆圈圈ooo 2026-03-30 3/150 2026-03-30 21:05 by 余震yz
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭