应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 求助 （已知遗传距离矩阵，怎么进行聚类分析）
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
71/1返回列表
查看: 2465  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

蔓菁

金虫 (正式写手)

[交流] 求助 （已知遗传距离矩阵，怎么进行聚类分析）

已知遗传距离矩阵：
如Genotype 全矩阵：
              2410          32_           4484             4594          4607            4632
2410        0.0000        0.8990        1.1882        1.1626        1.1843        1.2103
32_           0.8990        0.0000        0.6783        0.7261        0.9291        1.0177
4484        1.1882        0.6783        0.0000        0.2009        0.4018        0.2703
4594        1.1626        0.7261        0.2009        0.0000        0.2641        0.1736
4607        1.1843        0.9291        0.4018        0.2641        0.0000        0.2181
4632        1.2103        1.0177        0.2703        0.1736        0.2181        0.0000

或者半矩阵：
                   V2410                       V4484                        Bogra            Cypress
V2410        0                       
V4484        0.657608696        0               
Bogra        0.575688073        0.552197802        0       
Cypress        0.860294118        0.885057471        0.919117647        0

请问用什么软件进行聚类分析？
SAS？ DARwin？ 还是NTSYS pc？

请大侠赐教！

谢谢
我的email是 mhuang@cgiar.org

[ Last edited by 蔓菁 on 2008-11-13 at 10:44 ]
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2008-11-12 20:43:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蔓菁

金虫 (正式写手)
怎么没有人理睬啊？唔唔唔唔唔唔唔……
赞一下 回复此楼
2楼2008-11-13 10:45:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chibingjie

我只会用mega4聚类，你试试。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2008-11-13 16:01:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蔓菁

金虫 (正式写手)
没用过  好用不?

谢谢
赞一下 回复此楼
4楼2008-11-13 16:30:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shinevip

木虫 (正式写手)
matlab聚类还不错

[ Last edited by shinevip on 2008-11-13 at 20:05 ]
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2008-11-13 19:45:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

蔓菁

金虫 (正式写手)
请问有使用说明书不？  怎么将我发的那种矩阵做聚类分析？

谢谢
赞一下 回复此楼
6楼2008-11-13 20:35:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shinevip

木虫 (正式写手)
编过这方面的一个小程序,就用你的数据画了上面的图.
但不清楚其它生物信息学软件用的什么算法.
赞一下 回复此楼
7楼2008-11-13 20:50:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 蔓菁 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600，320分求调剂 +15 大馋小子 2026-04-04 16/800 2026-04-06 06:34 by houyaoxu
[有机交流] 3-溴吡啶-4-甲醛合成 10+3 雪糕也能爆炸 2026-03-31 9/450 2026-04-06 00:24 by nBu锂
[考研] 0855求调剂材料 +11 红桃灼灼 2026-04-04 11/550 2026-04-05 22:13 by 醉翁wl
[考研] 计算机11408，286分求调剂 +7 木子念晞 2026-04-05 7/350 2026-04-05 19:02 by chy09050039
[考研] 一志愿 南京航空航天大学 ，080500材料科学与工程学硕 +10 @taotao 2026-03-30 10/500 2026-04-05 17:57 by jj987
[考研] 358求调剂 +7 秋gk 2026-04-04 7/350 2026-04-05 13:29 by huangmoli
[考研] 工科277分求调剂材料 +8 上了上了上哦 2026-04-05 9/450 2026-04-05 13:05 by wwytracy
[考研] 调剂求助 +10 想换手机不想解� 2026-04-02 13/650 2026-04-05 09:41 by sam3303
[考研] 材料与化工363求推荐 +7 zh096 2026-04-04 7/350 2026-04-05 09:11 by 陌秋26
[考研] 可跨专业调剂 +3 周的得地 2026-04-04 6/300 2026-04-04 22:21 by barlinike
[考研] 291求调剂 +4 迷蒙木木 2026-04-01 5/250 2026-04-04 15:59 by sihailian3
[考研] 一志愿085404，总分291，四级已过，求调剂 +5 阿俊阿俊阿俊 2026-04-04 7/350 2026-04-04 13:23 by 莲菜就是藕吧
[考研] 调剂0855-288 +5 x熊二a 2026-04-03 5/250 2026-04-04 00:19 by 猪会飞
[考研] 一志愿重庆大学085404，总分314分，求调剂 +4 zf83hn 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:25 by 啵啵啵0119
[考研] 学硕288调剂!!! +3 小王xw123 2026-04-03 3/150 2026-04-03 21:20 by 啵啵啵0119
[考研] 求调剂机会 +5 意染ivy 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:13 by qoooooo614
[考研] 318求调剂，计算材料方向 +10 吸喵有害笙命 2026-04-01 11/550 2026-04-02 16:29 by oooqiao
[考研] 272求调剂，接受跨专业调剂！ +4 闲鱼卢 2026-03-31 4/200 2026-04-02 11:18 by guyan1000
[考研] 一志愿9初试366 本双非求调剂 +4 运气来得若有似� 2026-04-02 4/200 2026-04-02 09:56 by guanxin1001
[考研] 307分求调剂 +14 (o~o) 2026-03-31 15/750 2026-04-01 20:43 by longlotian
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭