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qchem

铁杆木虫 (著名写手)


[求助] molpro有原子数限制吗?

用随便画了几个结构
8个原子的能算出来
16个原子的能算出来
32个原子的和37个原子的就算不出来,输出文件没内容更新了,进程是还在跑,N天都这样
也没有出错信息

算的也不复杂呀都是CHON的原子,做MP2优化

顺便也测试了几个软件,感觉还是Gaussian最快,firefly其次,Orca再次
nwchem不收敛,molpro不出结果
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

编译的时候设置原子上限,默认可能是200。

检查cpu利用率。大体系计算加上direct会更快,尤其是梯度
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
2楼2016-07-25 17:09:27
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by beefly at 2016-07-25 17:09:27
编译的时候设置原子上限,默认可能是200。

检查cpu利用率。大体系计算加上direct会更快,尤其是梯度

CPU利用率没问题的,可能是因为是试用版的问题。

我就是想试试并行效率是不是很高,是买单机版还是研究组版。

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-07-25 22:16:23
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

引用回帖:
3楼: Originally posted by qchem at 2016-07-25 22:16:23
CPU利用率没问题的,可能是因为是试用版的问题。
我就是想试试并行效率是不是很高,是买单机版还是研究组版。
...

多组态方法并行不好,串行计算足矣。

单组态方法的单点能计算并行效率不错,但是解析梯度计算的io较大(密度拟合方法除外),早先的版本会使并行计算比串行还慢,必须要打开direct才行。2009以后的版本没试过。
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
4楼2016-07-26 09:46:12
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