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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 侯柱峰博士说明里面的shell脚本程序在那里写，怎样运行
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adailbj

新虫 (初入文坛)

[求助] 侯柱峰博士说明里面的shell脚本程序在那里写，怎样运行已有2人参与

刚自学vasp，Linux没有什么基础，我用的是centoes6.5和vasp3.5.5.请教各位大神：侯柱峰博士说明里面的下面这个shell脚本程序在哪里写，怎样运行，请详细说明。我应该看哪些资料或书。谢谢
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in 150 200 250 300 350 400
do
cat > INCAR <<!
SYSTEM = Si-Diamond
ENCUT = $i
ISTART = 0 ; ICHARG = 2
ISMEAR = -5
PREC = Accurate
!
echo "ENCUT = $i eV" ; time vasp
E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘
echo $i $E >>comment
done
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1楼2016-07-23 10:48:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雷克萨斯哈哈

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
adailbj: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-07-23 18:30:30
直接vi就可以啊，然后编辑，编辑完之后保存，然后./shell&可以啊，不知道你问的是不是我说的这样
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2楼2016-07-23 14:25:10
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adailbj

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 雷克萨斯哈哈 at 2016-07-23 14:25:10
直接vi就可以啊，然后编辑，编辑完之后保存，然后./shell&可以啊，不知道你问的是不是我说的这样

是你说的意思，shell脚本已经能运行了，谢谢。我还想问下，shell脚本程序和vasp怎样连接一起运行啊。我做都是shell和vasp分别运行，我刚一个人学习，身边人都不会，谢谢。
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3楼2016-07-23 18:33:50
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interding

金虫 (正式写手)
你的vasp运行是不是也要一个脚本的？如果是这样的话还需要在你的shell脚本里面加上调用vasp脚本的命令
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4楼2016-07-24 11:17:50
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刘阿林

新虫 (初入文坛)
再写一个和vasp绑定的脚本呗

发自小木虫Android客户端
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5楼2016-07-24 21:24:14
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hs0218

金虫 (正式写手)

DDr.

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
adailbj: 金币+3, ★★★很有帮助 2016-07-25 17:30:32
这个脚本的目的是设置INCAR里的某个值为变量，你再放上KPOINTS POSCAR POTCAR ，
然后 ./shell_name.sh 就可以了
希望你去看点基本的bash语言
赞一下(1人) 回复此楼
路漫漫其修远兮
6楼2016-07-25 14:35:16
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adailbj

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by interding at 2016-07-24 11:17:50
你的vasp运行是不是也要一个脚本的？如果是这样的话还需要在你的shell脚本里面加上调用vasp脚本的命令

已运行了，谢谢
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7楼2016-07-25 17:31:05
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羊小咩1314

禁虫 (初入文坛)
本帖内容被屏蔽
8楼2019-03-19 16:59:31
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qiqiangong

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 羊小咩1314 at 2019-03-19 16:59:31
ENCUT = 150 eV
./li.sh: line 13: vasp: command not found
请问回复说错在time vasp 中的vasp找不到应该怎么办...

同问啊，不知道怎么回事，不知道您解决了没？
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9楼2019-04-23 17:56:05
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