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adailbj

新虫 (初入文坛)

[求助] 侯柱峰博士说明里面的shell脚本程序在那里写,怎样运行 已有2人参与

刚自学vasp,Linux没有什么基础,我用的是centoes6.5和vasp3.5.5.请教各位大神:侯柱峰博士说明里面的下面这个shell脚本程序在哪里写,怎样运行,请详细说明。我应该看哪些资料或书。谢谢
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in 150 200 250 300 350 400
do
cat > INCAR <<!
SYSTEM = Si-Diamond
ENCUT = $i
ISTART = 0 ; ICHARG = 2
ISMEAR = -5
PREC = Accurate
!
echo "ENCUT = $i eV" ; time vasp
E=‘grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk ’{printf "%12.6f \n", $5 }’‘
echo $i $E >>comment
done
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雷克萨斯哈哈

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
adailbj: 金币+10, ★★★很有帮助 2016-07-23 18:30:30
直接vi就可以啊,然后编辑,编辑完之后保存,然后./shell&可以啊,不知道你问的是不是我说的这样
2楼2016-07-23 14:25:10
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adailbj

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 雷克萨斯哈哈 at 2016-07-23 14:25:10
直接vi就可以啊,然后编辑,编辑完之后保存,然后./shell&可以啊,不知道你问的是不是我说的这样

是你说的意思,shell脚本已经能运行了,谢谢。我还想问下,shell脚本程序和vasp怎样连接一起运行啊。我做都是shell和vasp分别运行,我刚一个人学习,身边人都不会,谢谢。
3楼2016-07-23 18:33:50
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interding

金虫 (正式写手)

你的vasp运行是不是也要一个脚本的?如果是这样的话还需要在你的shell脚本里面加上调用vasp脚本的命令
4楼2016-07-24 11:17:50
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刘阿林

新虫 (初入文坛)

再写一个和vasp绑定的脚本呗

发自小木虫Android客户端
5楼2016-07-24 21:24:14
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hs0218

金虫 (正式写手)

DDr.

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
adailbj: 金币+3, ★★★很有帮助 2016-07-25 17:30:32
这个脚本的目的是设置INCAR里的某个值为变量,你再放上KPOINTS POSCAR POTCAR ,
然后 ./shell_name.sh 就可以了
希望你去看点基本的bash语言
路漫漫其修远兮
6楼2016-07-25 14:35:16
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adailbj

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by interding at 2016-07-24 11:17:50
你的vasp运行是不是也要一个脚本的?如果是这样的话还需要在你的shell脚本里面加上调用vasp脚本的命令

已运行了,谢谢
7楼2016-07-25 17:31:05
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羊小咩1314

禁虫 (初入文坛)

本帖内容被屏蔽

8楼2019-03-19 16:59:31
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qiqiangong

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 羊小咩1314 at 2019-03-19 16:59:31
ENCUT = 150 eV
./li.sh: line 13: vasp: command not found
请问回复说错在time vasp 中的vasp找不到应该怎么办...

同问啊,不知道怎么回事,不知道您解决了没?
9楼2019-04-23 17:56:05
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