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菲顶顶

铜虫 (正式写手)

[求助] 关于PWSCF优化以后的结构转换问题 已有1人参与

请问大家,用QE有画完以后找到这一行A final scf calculation at the relaxed structure.后面跟着的下面几个部分就是优化的最终结果吧,优化后的结构要怎么转换一下变成输入文件的坐标呢。

第一部分(优化后这一部分几乎没变,是什么原因)
   2153      celldm(1)=   5.807593  celldm(2)=   1.000000  celldm(3)=   1.145762
   2154      celldm(4)=   0.000000  celldm(5)=   0.000000  celldm(6)=  -0.500000
第二部分(这一部分是指正格矢坐标吗,以alat为单位的,也就是以1.889为单位是吗还是celldm(1))
   2156      crystal axes: (cart. coord. in units of alat)
   2157                a(1) = (   0.988438   0.000000   0.000000 )
   2158                a(2) = (  -0.494219   0.856012   0.000000 )
   2159                a(3) = (   0.000000   0.000000   1.122375 )
第三部分(这一部分是指倒格矢坐标吗,以alat为单位的,也就是以1.889为单位是吗还是celldm(1))
   2161      reciprocal axes: (cart. coord. in units 2 pi/alat)
   2162                b(1) = (  1.011697  0.584104  0.000000 )
   2163                b(2) = (  0.000000  1.168207  0.000000 )
   2164                b(3) = (  0.000000  0.000000  0.890968 )
第四部分(这是最终得到的以alat问单位的坐标吗,我直接把他考到scf。in文件中单位设为{alat},这样正确吗?我直接这样做了计算,好想看起来没有什么不对,但是总感觉心里不塌实所以想要问问大家)
   2192    Cartesian axes
   2194      site n.     atom                  positions (alat units)
   2195          1           Mg  tau(   1) = (   0.0000000   0.0000000   0.0000000  )
   2196          2           B   tau(   2) = (   0.0000000   0.5706750   0.5611875  )
   2197          3           B   tau(   3) = (   0.4942190   0.2853375   0.5611875  )

以下为输入文件的坐标参数
     15     ibrav=4,celldm(1)=5.8075925237,celldm(2)=1,celldm(3)=1.14576228,celldm(4)=0,celldm(5)=0,   celldm(6)=-0.5,
     39 ATOMIC_POSITIONS {crystal}
     40 Mg  -0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000
     41 B    0.3333333429999996  0.6666666870000029  0.5000000000000000
     42 B    0.6666666269999979  0.3333333129999971  0.5000000000000000
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仲_______

金虫 (小有名气)

不懂,帮顶
2楼2016-07-23 00:48:27
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菲顶顶

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 仲_______ at 2016-07-23 00:48:27
不懂,帮顶

谢谢
3楼2016-07-23 22:07:45
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hexin1982

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
菲顶顶: 金币+5 2016-07-26 14:52:23
菲顶顶: 金币+5 2016-07-30 15:46:33
你上面列出来的应该和优化前的参数是一样的
4楼2016-07-24 17:18:28
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菲顶顶

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by hexin1982 at 2016-07-24 17:18:28
你上面列出来的应该和优化前的参数是一样的

是么意思呢 也就是说我的应该是正确的方法是吧
然后我想问下那个alat为单位到底是以celldm(1)=5.807593为单位的是吗
5楼2016-07-26 14:53:37
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hexin1982

新虫 (小有名气)


蛋蛋小童鞋: 金币+1 2016-07-26 19:23:03
引用回帖:
5楼: Originally posted by 菲顶顶 at 2016-07-26 14:53:37
是么意思呢 也就是说我的应该是正确的方法是吧
然后我想问下那个alat为单位到底是以celldm(1)=5.807593为单位的是吗...

alat是指以晶格常数a为单位的
6楼2016-07-26 19:17:42
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菲顶顶

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by hexin1982 at 2016-07-26 19:17:42
alat是指以晶格常数a为单位的...

哦哦,谢谢啦,我这个那就是以5.8为单位啦。直接考过来是和优化之前的应该是一样的,只是单位左边不太一样,优化前的原子位置是direct,优化后的到的是cartesion,以a为单位。弄清楚了

发自小木虫Android客户端
7楼2016-07-27 00:29:38
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