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银虫 (初入文坛)

[求助] 怎样用MS模拟聚合物链内旋角度与能量的关系以及聚合物链间的相互作用力

有三个问题
①老师最近想让用MS模拟聚合物链,想计算一下聚合物链自身旋转的角度与能量变化的关系,用MS能计算吗,怎么计算,构象的能垒能算吗,能得到旋转角度与能量的关系图吗?
②实际的聚合物不会只有一条链,能用MS建两条、三条或者更多的链模拟链间的相互作用力或者链旋转造成的空间位阻吗?
③下边是创腾的教程截图,是利用Conformers模块研究几何结构-能量相互关系,但是后边的点图PDF上没说怎么得到的,应该是用Conformers Tool得到的,请问那张图怎么得到的?
对于模拟刚接触,小白一个,可能问的有很多低级错误,有没有比较好的关于Amorphous Cell、Conformers、Forcite这几个模块好的教程推荐的,感谢各位

怎样用MS模拟聚合物链内旋角度与能量的关系以及聚合物链间的相互作用力
360截图20160721095707697.jpg


怎样用MS模拟聚合物链内旋角度与能量的关系以及聚合物链间的相互作用力-1
360截图20160721095735470.jpg
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