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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » 请教一个关于lammps做dpd计算的问题，谢谢大家
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wangzhikun

金虫 (小有名气)

[求助] 请教一个关于lammps做dpd计算的问题，谢谢大家

大家好，我用lammps做聚合物的dpd模拟研究的，遇到一个问题，第一张图所示为采用moltemplate构建的初始模型，构建过程中分子的化学键长度设置为7.66，盒子尺寸250*250*250（实际值为键长7.66埃，盒子边长250埃），在x方向我放了三个聚合物分子。然而在进行dpd模拟的过程中，聚合物分子尺寸自动收缩，如第二张图所示，化学键长度减小到了1.0左右，我采用的是pair_style dpd + bond来设置珠子之间的力场参数，并进行模拟NVT系综控温模拟。第三、四张图为我的data文件和in文件。请问大家，我的问题到底出在哪里呢？
这个问题困扰我好久了，请大家施以援手，必有金币重谢，感激不尽！

请教一个关于lammps做dpd计算的问题，谢谢大家
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请教一个关于lammps做dpd计算的问题，谢谢大家-1
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请教一个关于lammps做dpd计算的问题，谢谢大家-2
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请教一个关于lammps做dpd计算的问题，谢谢大家-3
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微笑，便是最好的生活态度。
1楼 2016-07-20 10:00:08
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wangzhikun

金虫 (小有名气)
自己回复一下，是因为data文件中 LJ 单位和real单位混淆了，使用moltemplate构建模型过程中也应该使用 LJ 单位。
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微笑，便是最好的生活态度。
2楼2016-07-22 11:50:59
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xingzhimeng

新虫 (初入文坛)
你好，我接触lammps不久，很抱歉不能回答你遇到的问题，但我想向你请教一个问题：我现在想用lammps做粗粒化模型，想问一下用moltemplate建好的初始模型如何转化为lammps可读的文件呢，希望能早日看到您的回复，非常感谢！
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3楼2016-07-27 16:55:08
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