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新虫 (初入文坛)

[交流] microRNA启动子区域的确定,诸位看下方法是否正确

1.目标:我要需要的是miR-140-5p的上游启动子序列(hsa)。

2.方法:

   2.1我上NCBI上在上方搜索条左侧的选项卡选择了 gene,输入了miR-140;

            



    2.2进入详情页后选择了 Go to nucleotide的 GenBank;



      2.3根据我查的文献说microRNA的启动子在从其序列开始 至 其转录方向的上游1000 到 2000bp区间内;



      2.4然后我将右方的Change region shown 的from后的左区间数改为了6993108,然后update view;



        2.5下方的Origin出现的序列信息就是启动子所在区域。



3.问题:大家看下我这个查找的过程是否正确,然后我想做在miR140的启动子区域上的VDR结合位点,之后我该作些什么呢。之前是数学专业,对生物不太了解,大家告诉我下大概流程,或者给我指点一两个相关文献,非常感谢!

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