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majun04

木虫 (著名写手)

majun

[交流] 【求助】过渡态的寻找QST2方法遇到困难

用QST2方法,叫gaussian自己找过渡态,输入程序(water_03.gjf),找到一个过渡态,输出文件(water_03.out)。然后把这个结构式保存,优化进行频率计算,输入文件(water_04.gjf),输出文件(water_04.out),一个虚频,较大,振动模式和成键相符合。然后对这个过渡态进行IRC计算,输入文件(water_IRC.gjf)。
现在遇到问题如下:
1、找到的过渡态,和我设计的反应物接近,但是与我的产物相差甚远,请问这样的过渡态对吗?本反应是放热反应,我想问一下,过渡态与反应物接近,或者是与产物接近,与反应放热吸热有没有关系?为什么会有关系?
2、假设我的过渡态是对的,在进行IRC计算的时候,当我用参数maxpoints=11的时候文件就能够正常结束,当用maxpoints=12的时候就不能结束,提示信息为:
>>>>>>>>>> Convergence criterion not met.
SCF Done:  E(RHF) =  -184.913792945     A.U. after  129 cycles
             Convg  =    0.6851D-02             -V/T =  1.8880
             S**2   =   0.0000
Convergence failure -- run terminated.
Error termination via Lnk1e in /home/majun/gaussian03/g03/l502.exe at Tue Nov 11 10:49:10 2008.
现在很困惑,请高手答疑。

输出文件超出512KB,没有上传。
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majun04

木虫 (著名写手)

majun

谢谢bylin的帮助!
乐观、执着、勤奋
5楼2008-11-11 16:21:44
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查看全部 7 个回答

虚谦

至尊木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
majun04(金币+2,VIP+0):谢谢你!我尝试一下看看
spur(金币+2,VIP+0):^_^ 3Q!!欢迎常来!
过渡态与你的产物相差甚远  说明在这条反应路径上还有过渡态你没有找到
对于irc不收敛你可以加iop(1/13=5)试试
大家都说我是个好人,其实,我也是这么想的~!
2楼2008-11-11 11:40:18
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majun04

木虫 (著名写手)

majun

引用回帖:
Originally posted by 虚谦 at 2008-11-11 11:40:
过渡态与你的产物相差甚远  说明在这条反应路径上还有过渡态你没有找到
对于irc不收敛你可以加iop(1/13=5)试试

QST2方法是不是只能找到一个点?要是有多个过渡态的话,我是不是应该把目前找到的”过渡态“分子式当成反应物,然后在编写输入文件,用QST2找过渡态?
请再次指导。
还有iop(1/13=5)是什么意思?能说详细些吗?
谢谢帮助。
乐观、执着、勤奋
3楼2008-11-11 11:48:05
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bylin

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★ ★
majun04(金币+4,VIP+0):谢谢你!
spur(金币+2,VIP+0):^_^ 3Q!!欢迎常来!
关于过渡态与反应物接近,还与是与产物接近,有一个它Hammond's Postulate,大意是:

如果在反应过程中有两个状态(比如说一个过渡态和一个反应中间体)相继出现,并且这两个状态的能量相差不大,那么这两个状态相互转变时的分子构型也不会有太大变化。

这个假定的一个有用推论就是,过渡态的分子结构会与在能量上和它相近的组分相似。如果一个反应是放热反应,那么反应物的能量高于产物的能量,但过渡态能量最高,在能量上过渡态就与反应物相近,根据Hammond's Postulate,它的分子结构也与反应物相近。这个过渡态就是前过渡态。

详细请参考http://www.answers.com/Hammond%20postulate
4楼2008-11-11 16:07:34
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