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xingyun5182

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助】请问如何用Gaussian计算分子结构参数?

我在看论文的时候看到Gaussian可以用来计算分子表面积,分子体积,疏水性参数,分子摩尔折射率,分子极化率。我想请问这些都是通过哪些关键词来实现的?如何准备输入文件?如何读取它们的输出文件?
谢谢了!
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张文艳

交流

★
jghe(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与!
我给你一个中文版本的G03 使用说明书,你自己看看就知道了,你把你的邮箱发上来,我给你传一个
2楼2008-11-10 16:48:23
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xingyun5182

铜虫 (初入文坛)

谢谢,fei8512@hotmail.com
其实我已经下载了那个“高斯应用大全”,里面也有中文版的说明书,英文版的我也大概能看明白,不过我只找到了一个Volume的关键词,其他的我还不知道,所以能否给点更具体的提示?谢谢了。
3楼2008-11-10 17:08:07
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
引用回帖:
Originally posted by xingyun5182 at 2008-11-10 15:35:
我在看论文的时候看到Gaussian可以用来计算分子表面积,分子体积,疏水性参数,分子摩尔折射率,分子极化率。我想请问这些都是通过哪些关键词来实现的?如何准备输入文件?如何读取它们的输出文件?
谢谢了!

你这个 chemoffice 中就有提供的了,你自己看一下 chem3d 的说明文档即可。
4楼2008-11-10 17:43:50
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xiaokeaini83

铜虫 (小有名气)

Gaussian可以用来计算分子 疏水性参数,分子摩尔折射率的么? 我都不知道呢  我也只知道算体积
5楼2008-11-10 18:53:04
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jghe

金虫 (著名写手)

★
zzgyb(金币+1,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
分子极化率 可以用关键词 polar 计算
6楼2008-11-10 21:00:36
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xingyun5182

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by snoopyzhao at 2008-11-10 17:43:


你这个 chemoffice 中就有提供的了,你自己看一下 chem3d 的说明文档即可。

嗯,其实在HyperChem的QSAR计算中也能算出这些来的,只不过我看了一篇文献说Gaussian可以算,我就想知道都是怎么算出来的。
7楼2008-11-11 09:33:48
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎再次光临计算模拟版!
比如疏水性参数,gaussian 是算不出来的,因为这是一个实验参数,我想文献中所说的可能是利用 gaussian 计算的物理化学参数来做 QSAR,然后获得预测值,这是可能的,也可能比较简单。只是,用这么大的计算代价换取一点点精度上可能的提高,是否有意义?
8楼2008-11-11 09:46:59
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