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kevinrowe

金虫 (著名写手)

[求助] XCMS对质谱图进行数据提取分析时,能不能分段设置参数? 已有2人参与

如题。各时间段的峰宽什么的都有差异,如果统一设置参数的话可能会影响结果可靠性。是否可以分段设置参数?求大神
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cyr001

银虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kevinrowe: 金币+2, 有帮助 2016-09-11 17:11:27
kevinrowe: 金币+2, ★★★很有帮助 2016-09-11 17:20:27
不能,建议你用你数据采集所使用仪器的公司出的软件来分析数据。
2楼2016-07-11 08:11:35
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applelover

新虫 (小有名气)

你是在peak picking 有问题还是alignment有问题? peak picking 用centwave,先是mass domain然后是chromatogrophy domain,在peakwidth参数里,设置一个峰宽的区间。 如果是非常宽的峰,很有可能xcms 最后peaktable里好多个feature其实来自一个峰,也OK啊,后面你会用CAMERA或者其他的软件对features进行annotation就好了。
3楼2016-09-06 01:32:40
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奔跑的萝卜丝

银虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
kevinrowe: 金币+6, 有帮助 2016-09-11 17:20:34
分段设置参数是的不可以的,可以先对质谱图进行手动预处理,以大概确定峰宽范围和保留时间偏移量,然后对参数进行设置

发自小木虫Android客户端
4楼2016-09-11 17:19:25
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