24小时热门版块排行榜    

查看: 2276  |  回复: 16

wlm0917

银虫 (正式写手)

[交流] 进化树建不好,求助 已有9人参与

如图。为什么我建得进化树是这样的? 数字都好小啊,数据来源是http://www.ezbiocloud.net/相似度都是大于90%的,怎么改。求助

进化树建不好,求助
图片1.png
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

ls2046

铁杆木虫 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by langyouxia at 2016-07-06 14:46:46
不是序列太远吗?越近相似度越好吧...

既然是树,当然要有枝,有干,有根,所以才叫树。那么从根到枝,就需要序列具有从远至近的不同的相似度,也才能做出比较科学的系统进化“树”。
一品黄山
5楼2016-07-06 16:38:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

416114799

至尊木虫 (知名作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
两个问题。一,左边的数字表示二者并一起的可靠性,而不是相似性。最低要60偶尔50多个别更低也可以。二,建树序列长短要尽量一致。网上比对相似性是根据彼此重叠部分来比的。你挑个序列长短900bp一个1500bp出来就是这结果。其实还有一种可能,是否你这些序列方向都一致?用DNAMAN把他们打开比对试试。

发自小木虫IOS客户端
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
8楼2016-07-08 07:38:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

枚的回忆

铁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
试试重新选择菌株再做
2楼2016-07-06 09:59:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ls2046

铁杆木虫 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
选的序列太近了,选远点试试。
一品黄山
3楼2016-07-06 12:38:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

langyouxia

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by ls2046 at 2016-07-06 12:38:32
选的序列太近了,选远点试试。

不是序列太远吗?越近相似度越好吧
4楼2016-07-06 14:46:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

陈楠19920225

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不是应该越到树枝时相似度越大吗?你这个怎么越来越小了?

发自小木虫Android客户端
6楼2016-07-07 18:04:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

陈楠19920225

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我过几天也要建树,这几天忙着考试呢。我听学姐说,blast对比完之后,可以选一些相似度高的序列建树。整体还要加个相似度小的为外源吧,我记得是。怎么关注这个帖子啊,我接下来也要做,想学学

发自小木虫Android客户端
7楼2016-07-07 18:08:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

疯狂的菜鸟

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
确定序列方向一致,选择ML算法试试
9楼2016-07-08 11:38:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

布娃娃5250

金虫 (正式写手)

我就是我
10楼2016-07-08 12:16:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wlm0917 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 我不理解! +19 Edward_pc 2026-08-26 27/1350 2026-09-02 12:08 by Ai19911123
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 16/800 2026-09-02 12:07 by Ai19911123
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 10/500 2026-09-02 11:35 by 大不刘6
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +4 瞬息宇宙 2026-09-01 8/400 2026-09-02 10:35 by 瞬息宇宙
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 8/400 2026-09-02 02:42 by Leogzhya
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 面上意见出来了 +12 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 23/1150 2026-08-31 18:57 by 黄鸟于飞Chao
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
信息提示
请填处理意见