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进化树建不好,求助 已有9人参与
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如图。为什么我建得进化树是这样的? 数字都好小啊,数据来源是http://www.ezbiocloud.net/相似度都是大于90%的,怎么改。求助 图片1.png |
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ls2046
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5楼2016-07-06 16:38:38
416114799
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两个问题。一,左边的数字表示二者并一起的可靠性,而不是相似性。最低要60偶尔50多个别更低也可以。二,建树序列长短要尽量一致。网上比对相似性是根据彼此重叠部分来比的。你挑个序列长短900bp一个1500bp出来就是这结果。其实还有一种可能,是否你这些序列方向都一致?用DNAMAN把他们打开比对试试。 发自小木虫IOS客户端 |

8楼2016-07-08 07:38:44
2楼2016-07-06 09:59:29
ls2046
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3楼2016-07-06 12:38:32
langyouxia
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4楼2016-07-06 14:46:46
6楼2016-07-07 18:04:43
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我过几天也要建树,这几天忙着考试呢。我听学姐说,blast对比完之后,可以选一些相似度高的序列建树。整体还要加个相似度小的为外源吧,我记得是。怎么关注这个帖子啊,我接下来也要做,想学学 发自小木虫Android客户端 |
7楼2016-07-07 18:08:37
疯狂的菜鸟
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9楼2016-07-08 11:38:24
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