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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 用MS构建CO2水合物氢键连接出现问题
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qw7706885er

金虫 (小有名气)

[求助] 用MS构建CO2水合物氢键连接出现问题 已有1人参与

用Forcite模块进行几何优化后使用calculate hydrogen bond重新计算氢键后发现有一部分氢键和笼形结构中间的CO2分子中的氧原子连接了起来，想请教下各位老师，怎么才能避免CO2分子连接氢键

用MS构建CO2水合物氢键连接出现问题
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1楼 2016-07-01 19:54:52
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)
楼主，你分析的应该是所有可能形成的氢键，那么如何分析特定成分的氢键呢？你现在会了么？请赐教呀
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2楼2016-07-29 15:57:23
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leebrave

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
qw7706885er: 金币+20 2016-08-18 22:55:48
你可以先co2移除再进行氢键的计算
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不慌，平常心，一步一步走过来。
3楼2016-08-18 22:14:39
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qw7706885er

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 赵红霞 at 2016-07-29 15:57:23
楼主，你分析的应该是所有可能形成的氢键，那么如何分析特定成分的氢键呢？你现在会了么？请赐教呀

还不会，，我是按楼下说的做的

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4楼2016-08-18 22:23:19
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23秒，32年

新虫 (初入文坛)
请问楼主CO2水合物模型是怎么建立的，原子坐标怎么确定，还有你是有6个还是8个CO2分子，谢谢楼主赐教？？
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5楼2016-11-26 21:09:58
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swannnn

新虫 (初入文坛)
楼主，请问您的水合物晶胞是如何确立的？

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6楼2018-09-16 19:28:39
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qw7706885er

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by swannnn at 2018-09-16 19:28:39
楼主，请问您的水合物晶胞是如何确立的？

我是根据findit里的晶体结构数据用MS建立的

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7楼2018-09-16 22:36:48
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