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轨丨迹

铜虫 (初入文坛)

[求助] 如何证明氨氮降低是硝化作用而不是微生物利用 已有2人参与

如题,分离得到了一些细菌,经过筛选对氨氮有去除作用,并且过程中有亚硝酸的产生。但是没有检测到amoA等关键基因,如何确定这株菌为硝化细菌而不是本微生物生长自身利用了。一般氨氮浓度可以从50mg/L降到10mg/L。
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yuyuwuxin

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
测总氮啊,连菌体一起测
2楼2016-06-30 12:25:46
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果是硝化菌,就不可能有亚硝酸盐产生。首先这是前提,对吧?你测到了亚硝酸肯定说明这个菌是反硝化菌,你测不到基因不代表它没有基因,要理解一个概念,你用的引物是别人或你自己根据已知序列设计的,并不能包含所有菌的基因。解决方法是找你这个菌相近的菌的功能基因设计引物,再pcr,即使如此也未必可以p到。各种条件要对。至于如何真正确定是否有该基因,最好的办法是全基因组测序。草图也就三五千块钱,精细图可能两三万。再做比对就靠谱了。不过你得确定该菌有研究价值,且确定有反硝化作用。

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做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
3楼2016-07-03 08:54:04
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

至于是否自身利用,如楼上所所就可以。可以改进下,离心反复洗涤再把菌体用milliQ水稀释,一点水就好。然后再加消解液消解。测出来总氮。单位是mg L-1 A600-1。记得测消解前od值

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做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
4楼2016-07-03 08:57:29
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