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神童熙熙

[交流] [求助]分子间氢键结构最低能量怎么计算？

比方说：
分子A和B之间形成氢键缔合物。

如果要计算缔合物的最低能量，是直接用虚线键画出氢键，将两个分子组合成一个分子来计算吗？

或者有其他办法呢？


各位达人如果有相关文献，能不能麻烦发到我邮箱？
谢谢各位了～

jiongjiong777@163.com
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1楼 2008-11-07 22:54:55
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spkeey

金虫 (正式写手)
★ ★
灯塔守望者(金币+2,VIP+0):谢谢支持小木虫
直接优化。opt，如果散开，先固定键长（估计的长度）opt。再放开优化，如还散开，减小优化步长。Gauss 没有 氢键的概念，就是 opt 找能量局域最低而已。它把它们当整个分子算的。
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SPKEEY
2楼2008-11-08 15:34:43
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张文艳

交流

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
把A和B两个物质尽量靠近，但不要使这两个化合物连接上，连上就变成一种新的物质了，在Chem3D中建构模型，保存成gjc文件，然后再转化成gjf文件，在再GaussianView中打开，调节键长，然后进行计算就行了，输出文件中就有形成复合物的能量-即氢键的能量
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3楼2008-11-10 09:55:20
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神童熙熙

好的 谢谢楼上了～！
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4楼2008-11-10 13:01:21
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