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nkleof

银虫 (正式写手)

[求助] npt升温体积膨胀 已有2人参与

在lammps里面用fix npt进行升温,总是会出现体积膨胀,一般会增加几个数量级,比如下面这次模拟,甚至出现报错:
# ------------------------ INITIALIZATION ----------------------
clear
units           real
dimension       3
boundary        p       p       p
atom_style      charge


# ----------------------- ATOM DEFINITION -----------------------

read_data       data.SiO2org222
# ------------------------ FORCE FIELDS -----------------------
pair_style      tersoff
pair_coeff * * SiO.tersoff Si O

#---------------------------Settings----------------------------
dump            amcfg  all cfg 10000 cfg/dump.*.cfg mass type xs ys zs
dump_modify     amcfg  element Si O
reset_timestep  0
thermo 100
thermo_style multi

#----------------------system equilibrated at 300K------------------
fix 2 all npt temp 300 300 100 iso 0 0 1000
run 100000

unfix 2
#----------------------temperature ramp to 5000K------------------
fix 2 all npt temp 300 5000 100 iso 0 0 1000
run 100000

unfix 2
#----------------------system equilibrated at 5000K-----------------
fix 2 all npt temp 5000 5000 100 iso 0 0 1000
run 100000

unfix 2
#----------------------quench from 5000K to 0.1K------------------
fix 2 all npt temp 5000 0.1 100 iso 0 0 1000
run 600000

unfix 2
unfix 1

运行到这一步时,出现错误:
#----------------------system equilibrated at 5000K-----------------
fix 2 all npt temp 5000 5000 100 iso 0 0 1000
run 100000
ERROR: Domain too large for neighbor bins (../neighbor.cpp:1683)

请高手来看一下,问题出在哪里?
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brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
nkleof(abinitio代发): 金币+5, 感谢应助 2016-06-29 15:20:13
nkleof: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢!请问更新列表需要自己设置什么命令吗? 2016-07-04 10:56:18
是不是因为近邻列表没有更新的缘故?5000开时二氧化硅熔化了吗?如果是液体状态一定要更新近邻列表。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2016-06-29 14:13:06
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abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
nkleof: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢!这个势函数是lammps自带的,文献上报道似乎可以进行液体二氧化硅模拟,会不会有其它问题? 2016-07-04 10:57:52
通过你的描述和报错信息来分析,你选用的势函数似乎有问题,建议进行验证。
3楼2016-06-29 15:21:06
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慕容仙尘

新虫 (初入文坛)

请问这个问题解决了吗?我现在也在算聚合物熔化的问题,体积也会膨胀很多!
4楼2016-07-12 12:44:07
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11B329

金虫 (正式写手)

从300到5000,二氧化硅都变成气态了吧?

发自小木虫Android客户端
往前走吧!
5楼2016-07-13 08:05:37
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11B329

金虫 (正式写手)

请问在0外压的情况下,二氧化硅的熔点是多少?

发自小木虫Android客户端
往前走吧!
6楼2016-07-13 08:07:40
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