24小时热门版块排行榜    

查看: 2440  |  回复: 5

nkleof

银虫 (正式写手)

[求助] npt升温体积膨胀 已有2人参与

在lammps里面用fix npt进行升温,总是会出现体积膨胀,一般会增加几个数量级,比如下面这次模拟,甚至出现报错:
# ------------------------ INITIALIZATION ----------------------
clear
units           real
dimension       3
boundary        p       p       p
atom_style      charge


# ----------------------- ATOM DEFINITION -----------------------

read_data       data.SiO2org222
# ------------------------ FORCE FIELDS -----------------------
pair_style      tersoff
pair_coeff * * SiO.tersoff Si O

#---------------------------Settings----------------------------
dump            amcfg  all cfg 10000 cfg/dump.*.cfg mass type xs ys zs
dump_modify     amcfg  element Si O
reset_timestep  0
thermo 100
thermo_style multi

#----------------------system equilibrated at 300K------------------
fix 2 all npt temp 300 300 100 iso 0 0 1000
run 100000

unfix 2
#----------------------temperature ramp to 5000K------------------
fix 2 all npt temp 300 5000 100 iso 0 0 1000
run 100000

unfix 2
#----------------------system equilibrated at 5000K-----------------
fix 2 all npt temp 5000 5000 100 iso 0 0 1000
run 100000

unfix 2
#----------------------quench from 5000K to 0.1K------------------
fix 2 all npt temp 5000 0.1 100 iso 0 0 1000
run 600000

unfix 2
unfix 1

运行到这一步时,出现错误:
#----------------------system equilibrated at 5000K-----------------
fix 2 all npt temp 5000 5000 100 iso 0 0 1000
run 100000
ERROR: Domain too large for neighbor bins (../neighbor.cpp:1683)

请高手来看一下,问题出在哪里?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brucefan

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
nkleof(abinitio代发): 金币+5, 感谢应助 2016-06-29 15:20:13
nkleof: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢!请问更新列表需要自己设置什么命令吗? 2016-07-04 10:56:18
是不是因为近邻列表没有更新的缘故?5000开时二氧化硅熔化了吗?如果是液体状态一定要更新近邻列表。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2016-06-29 14:13:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
nkleof: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢!这个势函数是lammps自带的,文献上报道似乎可以进行液体二氧化硅模拟,会不会有其它问题? 2016-07-04 10:57:52
通过你的描述和报错信息来分析,你选用的势函数似乎有问题,建议进行验证。
3楼2016-06-29 15:21:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

慕容仙尘

新虫 (初入文坛)

请问这个问题解决了吗?我现在也在算聚合物熔化的问题,体积也会膨胀很多!
4楼2016-07-12 12:44:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

11B329

金虫 (正式写手)

从300到5000,二氧化硅都变成气态了吧?

发自小木虫Android客户端
往前走吧!
5楼2016-07-13 08:05:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

11B329

金虫 (正式写手)

请问在0外压的情况下,二氧化硅的熔点是多少?

发自小木虫Android客户端
往前走吧!
6楼2016-07-13 08:07:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 nkleof 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] filecode +12 documentary 2026-08-10 14/700 2026-08-12 15:47 by 医学老男孩
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +4 majunge000 2026-08-10 4/200 2026-08-12 15:46 by 云上清扬
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +22 Lanmanbaby 2026-08-09 35/1750 2026-08-12 14:38 by sdfapple719
[基金申请] 长年满屏的广告,版主太不责任了。基金也等的急 +3 gltch 2026-08-12 3/150 2026-08-12 13:25 by dcqxinyang
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +5 Tide man 2026-08-11 5/250 2026-08-12 09:24 by kangban
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +3 majunge000 2026-08-11 4/200 2026-08-11 20:13 by lch2012
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
信息提示
请填处理意见