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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 急求助！！！！-Materials Studio 5.5版本中如何搭建Pr0.6Sr0.4MnO3晶格
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gexingshuo

银虫 (初入文坛)

[求助] 急求助！！！！-Materials Studio 5.5版本中如何搭建Pr0.6Sr0.4MnO3晶格 已有1人参与

在Materials Studio 5.5版本中搭建好正交结构的PrMnO3结构后，在进行原子替代时如何将原结构替换为Pr0.6Sr0.4MnO3晶格结构。
我搭建的PrMnO3结构为初级单包结构。
希望各位大神帮忙！
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1楼 2016-06-24 10:20:24
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by gexingshuo at 2016-06-26 09:06:58
您说的晶体结构是指XRD还是MS中有标准的Pr0.6Sr0.4MnO3，我是新手，而且不知道怎么讲您说的标准结构导出。
希望您多多指点。
急求！！！！！！
谢谢！...

MS中没有自带该晶体结构，需要自己根据XRD数据解晶体结果建立晶体。该晶体已有文献给出了晶体数据，如我在2楼给出的。
建立是晶体是MS操作中最基础的，也很简单，请自行学习之。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
4楼2016-06-26 09:16:08
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by magicmonk at 2016-06-28 15:13:47
版主，这个好像是分数占位的，用于计算的话不太方便吧...

Pr0.6Sr0.4MnO3这样的结构式，其中有小数的下标，一般都有分数占位的。在MS中，分数占位的建模，也不困难。
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10楼2016-06-28 15:22:52
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
11楼: Originally posted by magicmonk at 2016-06-28 15:39:47
我不是指建模，是说用于计算？VASP估计是没戏了...

现在催化研究中催化剂掺杂很常见，那VASP用不了么？MS应该计算的。
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12楼2016-06-28 15:42:16
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普通回帖

月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
个人认为，在搭建好的PrMnO3基础上，通过原子替代等方式，构建Pr0.6Sr0.4MnO3的方法不妥。
数据库中有正交的Pr0.6Sr0.4MnO3晶体结构数据，直接构建即可：

*data for   ICSD #55390
Coll Code   55390
Rec  Date   2005/10/01
Chem Name   Praseodymium Strontium Manganatee (0.4/0.6/1)
Structured  (Pr0.4 Sr0.6) (Mn O3)
Sum         Mn1 O3 Pr0.4 Sr0.6
ANX         ABX3
D(calc)     6.27
Title       Structure, magnetism, and transport properties of Pr1-x Srx Mn O3 (x
            = 0.45 - 0.75 ) up to 1200 K
Author(s)   Knizek, K.;Hejtmanek, J.;Jirak, Z.
Reference   Chemistry of Materials (1,1989-
            (2004), 16(6), 1104-1110
Unit Cell   7.5161(3) 7.7928(3) 7.6587(3) 90 90 90
Vol         448.58
Z           8
Space Group F m m m
SG Number   69
Cryst Sys   orthorhombic
Pearson     oF40
Wyckoff     i h g f d
R Value     .0274
Red Cell    F  5.365 5.365 5.413 119.094 119.094 91.076 112.145
Trans Red   -0.500 0.000 -0.500 / -0.500 0.000 0.500 / 0.500 0.500 0.000
Comments    Neutron diffraction (powder)
            The structure has been assigned a PDF number (calculated
            powder diffraction data): 01-073-7844
            Rietveld profile refinement applied
            Temperature in Kelvin: 10
            Structure type : (Pr,Sr)MnO3
            At least one temperature factor missing in the paper.
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H
Pr   1  +3    8 h   0.          0.2507(2)   0.             0.40       0   
Sr   1  +2    8 h   0.          0.2507(2)   0.             0.60       0   
Mn   1  +3.6  8 d   0.25        0.          0.25           1.         0   
O    1  -2    8 g   0.2188(1)   0.          0.             1.         0   
O    2  -2    8 i   0.          0.          0.2822(1)      1.         0   
O    3  -2    8 f   0.25        0.25        0.25           1.         0   
*end for    ICSD #55390
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2楼2016-06-24 11:22:14
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gexingshuo

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2016-06-24 11:22:14
个人认为，在搭建好的PrMnO3基础上，通过原子替代等方式，构建Pr0.6Sr0.4MnO3的方法不妥。
数据库中有正交的Pr0.6Sr0.4MnO3晶体结构数据，直接构建即可：

*data for   ICSD #55390
Coll Code   55390
Rec  Da ...

您说的晶体结构是指XRD还是MS中有标准的Pr0.6Sr0.4MnO3，我是新手，而且不知道怎么讲您说的标准结构导出。
希望您多多指点。
急求！！！！！！
谢谢！
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3楼2016-06-26 09:06:58
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gexingshuo

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 月只蓝 at 2016-06-26 09:16:08
MS中没有自带该晶体结构，需要自己根据XRD数据解晶体结果建立晶体。该晶体已有文献给出了晶体数据，如我在2楼给出的。
建立是晶体是MS操作中最基础的，也很简单，请自行学习之。...

呢。我明白您的意思。您是说安按照您给的Pr0.6Sr0.4MnO3晶体中各原子的坐标建立就行
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5楼2016-06-26 09:24:12
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月只蓝

主管区长 (职业作家)
引用回帖:
5楼: Originally posted by gexingshuo at 2016-06-26 09:24:12
呢。我明白您的意思。您是说安按照您给的Pr0.6Sr0.4MnO3晶体中各原子的坐标建立就行...

是的。
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6楼2016-06-26 10:12:43
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gexingshuo

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 月只蓝 at 2016-06-26 10:12:43
是的。...

谢谢！ 我先试试不懂再问您
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7楼2016-06-26 10:49:17
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gexingshuo

银虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 月只蓝 at 2016-06-26 10:12:43
是的。...

顺便问一下，对于计算钙钛矿锰氧化物，一般采取什么收敛函数，是GGA还是LDA+U呢！同时对于加U的数值怎么确定。谢谢
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8楼2016-06-26 10:50:53
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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2016-06-24 11:22:14
个人认为，在搭建好的PrMnO3基础上，通过原子替代等方式，构建Pr0.6Sr0.4MnO3的方法不妥。
数据库中有正交的Pr0.6Sr0.4MnO3晶体结构数据，直接构建即可：

*data for   ICSD #55390
Coll Code   55390
Rec  Da ...

版主，这个好像是分数占位的，用于计算的话不太方便吧
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我们最深的恐惧不是我们能力不够，我们最深的恐惧是能力超越了极限。
9楼2016-06-28 15:13:47
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