| 查看: 2252 | 回复: 1 | |||
[求助]
关于MS软件中的DMol3模块的一些问题想请高人讲解！
|
|
我们现在正在学催化方面的一些计算，由于刚刚学习，所以很多都不懂，最近老师让我按一篇文献上的计算方法进行相关计算，但是我看的不是太懂，所以请对这方面有了解的人指点一二，文献内容如下： 用Materials Studio软件包中的DMol3模块进行所有的DFT计算。 （111）晶面作为热力学最稳定的表面，是常见的金属催化剂中含量最多的晶面。因此，我们选取Pd（111）晶面作为我们的模型催化剂，采用周期性超晶胞模型来模拟。对低覆盖度Pd（111）表面建立周期性三层层晶p（2×2）模型，每层含有四个Pd原子；而对于相对高的覆盖度表面采用三层（√3×√3）R30°模型来模拟，每层含有三个Pd原子。为了减少周期性层板之间的相互作用，Pd（111）薄面预留10A的真空层。计算过程采用Monkhorst-Pack方法自动生成的（6×6×2）K点设置。在几何结构优化过程中，底层的Pd原子固定在其体相点阵（3.891A），其余原子坐标完全放松弛豫。所有的反应都发生在Pd（111）平板模型的一侧，每个超晶胞只允许吸附一个被吸附物分子。其相对应的表面覆盖度为1/4和1/3.对体系能量、梯度、位移设置的迭代收敛标准分别为1×10＾-5Hartree、2×10＾-3Hartree/A/5×10＾-3A. 我想问一下： 1、“对低覆盖度Pd（111）表面建立周期性三层层晶p（2×2）模型，每层含有四个Pd原子。”中怎么建立三层的层晶？和p（2×2）在哪里设置？ 2、“对于相对高的覆盖度表面采用三层（√3×√3）R30°模型来模拟”中（√3×√3）R30°模型在MS中哪里找到这个模型？ 3、“为了减少周期性层板之间的相互作用，Pd（111）薄面预留10A的真空层”中怎么预留10A的真空层，在哪输入？ 4、Monkhorst-Pack方法是什么方法？ 5、“在几何结构优化过程中，底层的Pd原子固定在其体相点阵（3.891A），其余原子坐标完全放松弛豫。”中底层的Pd原子怎么固定在它的体相点阵3.891A中？ 以上就是我的问题，希望有高人能来解答，非常感谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
基金申请
已经有44人回复
-
CSC与新西兰维多利亚大学PhD奖学金项目
已经有0人回复
-
物理学I论文润色/翻译怎么收费?
已经有126人回复
-
新西兰Robinson研究所 招聘CSC公派访问人员
已经有0人回复
-
帮我的英语口语老师找学生
已经有0人回复
-
什么时候开奖？
已经有13人回复
-
散金币祈福
已经有94人回复
-
青基已中
已经有1人回复
-
散金币祈福
已经有185人回复
-
求助，如何提取ELK的rt-TDDFT在某一时刻的自旋密度分布和电子密度分布
已经有1人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
不取俗名
木虫 (正式写手)
- 应助: 83 (初中生)
- 金币: 2866.5
- 散金: 78
- 红花: 11
- 帖子: 676
- 在线: 84.3小时
- 虫号: 3121021
- 注册: 2014-04-08
- 专业: 理论和计算化学
2楼2016-06-23 00:26:29
30