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新虫 (初入文坛)

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[求助] 菌种鉴定：DNA杂交实验已有1人参与

求助，如何做DNA杂交实验，谢谢~

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越努力，越幸运~

1楼 2016-06-20 09:46:07

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二十一业

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

1.DNA-DNA杂交（DDH）实验对DNA提取质量、操作过程及设备都有比较高的要求，建议选择有相应成熟工作条件的单位做。前提是你有目的待选标准菌株。一对菌株的试验约2000-4000不等，每增加一个标准菌株实验都需要额外增加费用成本。
2.改用isDDH，即基于基因组序列与已知参考基因组数字杂交，这个是比较方便快捷的。参考基因组可选genebank中已有的，只需受测菌株测基因组一次，然后与标准菌株基因组计算isDDH/ANI即可。这个方法也是基因组时代菌种鉴定金标准。