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heck金虫 (正式写手)
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【资源】核酸序列的一般分析流程
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【网址】核酸序列的一般分析流程 核酸序列的一般分析流程 1 核酸序列的检索 http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=Nucleotide 2 核酸序列的同源性分析 2.1 基于NCBI/Blast软件的核酸序列同源性分析 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/blast.cgi 2.2 核酸序列的两两比较 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/bl2.html 2.3 核酸序列的批量联网同源性分析(方案) 3 核酸序列的电子延伸 3.1 利用UniGene数据库进行电子延伸(方案) 3.2 利用Tigem的EST Machine进行电子延伸 EST Extractor: http://gcg.tigem.it/blastextract/estextract.html EST Assembly: http://www.tigem/ESTmachine.html 3.3 利用THC数据库对核酸序列进行电子延伸 http://gcg.tigem.it/UNIBLAST/uniblast.html 4 核酸序列的开放阅读框架分析 4.1基于NCBI/ORF finder的ORF分析 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html 5 基因的电子表达谱分析 5.1 利用UniGene数据库进行电子表达谱分析（方案） 5.2利用Tigem的电子原位杂交服务器进行电子表达谱分析 http://gcg.tigem.it/INSITU/insitublast.html 6 核酸序列的电子基因定位分析 6.1 利用STS数据库进行电子基因定位 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/sts/epcr.cgi 6.2 利用UniGene数据库进行电子基因定位（方案） 7 cDNA的基因组序列分析 7.1 通过从NCBI查询部分基因组数据库进行基因组序列的分析(方案) 7.2 通过从NCBI查询全部基因组数据库进行基因组序列的分析 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geno ... tml&&ORG=Hs 7.3 通过从Sanger Centre查询基因组数据库进行基因组序列的分析 http://www.sanger.ac.uk/HGP/blast_server.shtml 8 基因组序列的初步分析 8.1 基因组序列的内含子/外显子分析 http://www.bioscience.org/urllists/genefind.htm 8.2 基因组序列的启动子分析 http://www-hgc.lbl.gov/projects/promoter.html 9核酸序列的注册 9.1 EST序列的注册(方案) 9.2 较长或全长cDNA序列的注册(方案) 10待分析序列所对应的已知克隆的获取 http://image.llnl.gov |
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