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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 热点前沿问题讨论 » 计算吸附H原子的吸附能
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★
漫天飘雪: 金币+2, 谢谢交流 2016-08-03 15:38:41
引用回帖:
10楼: Originally posted by luomin_zyj at 2016-06-14 14:45:48
收到，谢谢大侠...

2D系统，如果认为这个slab远大于一个分子，则可按照xy周期性进行近似。

如果是按照电化学过程考虑的话，析氢反应中，如果MoS2作为负极，H+到金属表面前可能就很可能被还原成H·了（Frank-Condon原理）。

超胞取多大，要看你打算研究的覆盖度是如何的，低覆盖度需要的超胞相对大。孤立原子的吸附（如Langmuir吸附），随着超胞增加只要吸附能收敛即可。k取多少取决于“收敛性测试”。
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
11楼2016-06-15 01:40:25
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luomin_zyj

捐助贵宾 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 卡开发发 at 2016-06-15 01:40:25
2D系统，如果认为这个slab远大于一个分子，则可按照xy周期性进行近似。

如果是按照电化学过程考虑的话，析氢反应中，如果MoS2作为负极，H+到金属表面前可能就很可能被还原成H·了（Frank-Condon原理）。

超胞 ...

我现在在计算体系的吉普斯自由能，以前没做过，具体细节不清楚，听了大侠们的建议和参考文献，好像有点清楚了，谢谢大侠们
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12楼2016-06-15 10:12:58
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
12楼: Originally posted by luomin_zyj at 2016-06-15 10:12:58
我现在在计算体系的吉普斯自由能，以前没做过，具体细节不清楚，听了大侠们的建议和参考文献，好像有点清楚了，谢谢大侠们...

文献也给一个，dx.doi.org/10.1021/jp400608p。
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
13楼2016-06-15 10:19:07
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前田庆次

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

计算二维材料如MoS2氢原子的吸附能，用vasp计算，吸附面为Z方向，那么在X，y方向要不要加真空，还是要维持周期性条件？
维持周期性条件，不用加真空
超胞取多大合适，太大的话计算内存越大，就算不了了，
这个不好说，当然，通常认为4X4就可以忽略H与H原子之间的作用了，3X3也可
可不可以KPOINTS选1 1 1 ， 原子多一点（100-200）？
没这么干过，不清楚
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长枪一横花飘零，松风追月伴我行。无双人间世如梦，倾奇万世永留名。
14楼2016-06-18 08:23:27
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luomin_zyj

捐助贵宾 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by 前田庆次 at 2016-06-18 08:23:27
计算二维材料如MoS2氢原子的吸附能，用vasp计算，吸附面为Z方向，那么在X，y方向要不要加真空，还是要维持周期性条件？
维持周期性条件，不用加真空
超胞取多大合适，太大的话计算内存越大，就算不了了，
这个不 ...

谢谢大侠
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15楼2016-06-18 14:57:18
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前田庆次

木虫 (著名写手)
引用回帖:
15楼: Originally posted by luomin_zyj at 2016-06-18 14:57:18
谢谢大侠...

16楼2016-06-18 20:22:15
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luomin_zyj

捐助贵宾 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 沉默是金8138 at 2016-06-13 10:02:32
首先 我认为你算的不是H原子吸附，应该是电化学中的H离子在MoS2吸附吧？
如果我猜的正确的话，你的POTCAR选择应该是有问题的。
至于你所说的其他超胞，Kpoints什么的就没有继续讨论的必要了

大侠，您这里说的POTCAR有问题是指函数本身还是在选择势函数有特别地方？
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17楼2020-05-25 18:27:04
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