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达硕_在鑫

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[交流] 基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）已有3人参与

代谢组学(Metabolomics)
Ø研究生命体对于内在基因突变、病理生理变化及外在环境等因素刺激作用下的体内的动态多元的代谢物响应
Ø定性定量描述生物体内所有内源性代谢物
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）\"$
代谢组学研究方法
应用研究——>解决实际生物医学问题和需求
高通量信息获取——>生物信息学研究
小分子代谢物表征——>针对复杂体系生物样本样品的高分辨分离分析
代谢组学研究流程
1.样本采集—>2.样本预处理—>3.代谢组数据采集—>4.数据分析—>5.生物解释
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-1\"$
代谢物的定性仍然是发展的瓶颈！
普遍认为，常规方法(主要指LC-MSn、GC-MS和NMR)能检测和鉴别的代谢物应不到样品中代谢物总量的10-15%。
生物体内代谢物的数量尚无定论，有说1,000-200,000，亦有说4,000-20,000不等。
如何提高代谢物鉴定分析的成功率：是一个非常重要的问题~
代谢物的鉴定：为什么有难度！
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-2\"$
代谢物的鉴定：分析流程
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-3\"$
问题一：如何提高定性分析的准确性？

问题二：如何更快速、更多地定性出代谢物？

问题三：如何在定性分析确认的过程中节约时间、降低成本？

===解决方案===
国内重点的代谢组学研究组开发《代谢组学小分子化合物快速鉴定分析软件系统（OSI/SMMS）》
OSI/SMMS系统介绍：
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-7\"$
—>自建标准数据库：基于高分辨质谱分析的实际数据采集利用。

—>标准数据库的构建

—>如何将有效信息综合利用：保留时间、一级质谱与二级质谱
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-10\"$
—>更高效的鉴定：主要网络数据库的整合利用
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-11\"$
—>组内共享自建库与扩展库：让定性经验得以传递
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-12\"$
—>快速、准确的一站式定性分析
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-13\"$
—>多级用户管理

关键技术
—>如何利用保留时间信息：SOP方法
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-15\"$
—>数据校正：内标的使用
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-16\"$
—>从MS1到MS2：MS2质谱列表的预处理
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-17\"$
—>发表的文章：Anal. Chem. 2015, 87, 5050−5055, DOI: 10.1021/acs.analchem.5b00615
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-18\"$
—>确定噪声水平
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-19\"$
—>确定峰纯度
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-20\"$
—>如何处理多个二级质谱特征
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-21\"$
—>定性匹配算法：正向搜索、反向搜索与加权打分
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-22\"$
—>如何利用峰强度信息
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-23\"$
===实际案例===
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-24\"$
—>鉴定分析流程
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-25\"$
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-26\"$
—>分析结果
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-27\"$
—>典型定性结果
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-28\"$
===代谢小分子鉴定分析的最佳解决方案===
$\"基于LC-MSn的代谢小分子化合物快速鉴定分析软件（OSI/SMMS）-29\"$
此系统由大连达硕信息技术有限公司与中科院大连化物所代谢组学研究中心共同开发
有需要咨询的，可以留言或与达硕联系！

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1楼 2016-06-06 16:20:21

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达硕_在鑫

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gaofeng524

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与waters的QA比较有何优缺点？

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3楼2016-06-06 21:47:15

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引用回帖:

3楼: Originally posted by gaofeng524 at 2016-06-06 21:47:15
与waters的QA比较有何优缺点？

您指的是waters的QI？我对QI不熟悉，而且并没有可比性，他们的系统更多的在于数据解析的能力，我们的系统主要解决定性的问题。waters、赛默飞我们都与工程师正面沟通过，有深入交流！

OSI/SMMS系统缺点：我们目前版本没有加入峰的处理方法，我们目前只关注定性，定性的匹配算法，如何让定性更方便，更准确！
OSI/SMMS系统介绍
该系统主要是解决代谢小分子鉴定分析和快速、批量分析的问题，也是代谢小分子验证分析的有效工具。无需费时、费力、费钱地购买标准化合物，进行一系列的实验分析与数据分析，最终确定鉴定结果是否准确可靠，而是基于系统自带的标准化合物实验数据库、网络数据库，以及定性共享数据库等完成鉴定确认(详情请参见系统的特色与优势)

OSI/SMMS优势
1.发展基于多层次定性体系的代谢物鉴定新策略，即购买标准化合物并自建具有完整信息的数据库、整合主流网络数据库、积累并整合研究组内成员的定性研究成果与经验，实现大规模代谢特征的定性鉴定与验证。
2.自建数据库：以SOP的方法，购买近1500多个标准化合物，在正、负离子模式，以及高、中、低三个能量下，采集每个化合物的保留时间、一级质谱、二级质谱信息，构建信息完整的标准数据库[数据由中国科学院大连化学物理研究所，代谢组学研究中心采集]。
3.整合网络数据库：软件系统同时实现HMDB、Metlin、Lipid maps和MMCD4个主要网络数据库的实时、在线搜索，并整合搜索结果，用户无需再登录网站便可快速便捷地得到批量结果。而不是像过去那样，需要在不同网络数据库间不断输入、人工比较或整合结果。
4.整合扩展数据库：系统通过构建扩展数据库，以及本地电脑与局域网数据联机的方式，实现研究组内成员间定性研究成果的建库、积累与共享。我们的代谢组学研究不再孤立无援，而是在研究组内既分享别人的定性经验或成果、同时也为研究组做出自己的贡献。
5.定性算法与用户体验：系统通过发展先进的数据校正算法，以及先进的定性分析方法，实现未知代谢特征与数据库的准确匹配，完成代谢物的快速、批量定性分析。
与此同时，系统体验优异，包括数据的批量导入、查询、可视化，以及结果输出等诸多对代谢组学研究很有帮助的功能。

谢谢您的提问！

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4楼2016-06-07 15:12:03

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